Package: r-bioc-scater (1.32.1+ds-1)

[ Source: r-bioc-scater  ]

Enkelt-celle analyseværktøjssæt for genudtryksdata i R

En samling af værktøjer til at udføre diverse analyser af enkelt-celle RNA-seq-genudtryksdata, med et fokus på kvalitetskontrol og visualisering.

Other Packages Related to r-bioc-scater

• dep: r-api-4.0

  virtual package provided by r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.19

  virtual package provided by r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-beachmat (>= 2.20.0)

  I/O for several formats storing matrix data

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.50.0)

  Generiske funktioner for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocneighbors (>= 1.22.0)

  Nearest Neighbor Detection for Bioconductor-pakker

• dep: r-bioc-biocparallel (>= 1.38.0)

  BioConductor - faciliteter for parallel evulering

• dep: r-bioc-biocsingular (>= 1.20.0)

  Singular Value Decomposition for Bioconductor Packages

• dep: r-bioc-delayedarray (>= 0.30.1)

  BioConductor delayed operations on array-like objects

• dep: r-bioc-matrixgenerics (>= 1.16.0)

  S4-genriske summeringsstatistikfunktioner der fungerer på matrix-lignende objekter

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.42.1)

  BioConductor S4-implementering af vektorer og lister

• dep: r-bioc-scuttle (>= 1.14.0)

  BioConductor enkelt-celle RNA-Seq-analyseredskaber

• dep: r-bioc-singlecellexperiment (>= 1.26.0)

  S4 Classes for Single Cell Data

• dep: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.34.0)

  BioConductor - assay-container

• dep: r-cran-ggbeeswarm

  GNU R-kategorisk punktplot (violin-punkt)

• dep: r-cran-ggplot2

  Implementering af Grammar of Graphics

• dep: r-cran-ggrastr

  Bioconductor rasterize layers for 'ggplot2'

• dep: r-cran-ggrepel

  Automatisk positionering ikkeoverlappende tekstetiketter i plot

• dep: r-cran-matrix

  GNU R-pakke til klasser for tætte matricer og matricer med få udfald

• dep: r-cran-pheatmap

  GNU R-pakke til at oprette smukke varmekort

• dep: r-cran-rcolorbrewer

  GNU R-pakke der tilbyder egnede farvepaletter

• dep: r-cran-rcppml

  GNU R Rcpp Machine Learning Library

• dep: r-cran-rlang

  Funktioner for basistyper samt Core R- og »Tidyverse«-funktioner

• dep: r-cran-rtsne

  GNU R - T-Distributed Stochastic Neighbor Embedding via en Barnes-Hut

• dep: r-cran-uwot

  GNU R - ensartet manifold-tilnærmelse og projektion (UMAP)

• dep: r-cran-viridis

  GNU R package for color maps from matplotlib

• sug: r-bioc-biobase (>= 2.64.0)

  Grundlæggende funktioner for Bioconductor

• sug: r-bioc-biocstyle (>= 2.32.1)

  Standardstile for vignettes og andre Biocunductor-dokumenter

• sug: r-bioc-biomart (>= 2.60.1)

  GNU R Interface til BioMart-databsaer (Ensembl, COSMIC, Wormbase og Gramene)

• sug: r-bioc-densvis (>= 1.14.0)

  density-preserving data visualization via non-linear dimensionality reduction

• sug: r-bioc-scrnaseq (>= 2.18.0)

  Samling af Public Single-Cell RNA-seq-datasæt

• sug: r-cran-cowplot

  GNU R streamlined plot theme and plot annotations for 'ggplot2'

• sug: r-cran-knitr

  GNU R-pakke for dynamisk rapportoprettelse via Literate Programming

• sug: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

• sug: r-cran-robustbase

  GNU R-pakke der tilbyder grundlæggende robust-statistik

• sug: r-cran-scattermore

  GNU R-punktplot med flere punkter

• sug: r-cran-testthat

  GNU R-testpakke

Download r-bioc-scater

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	539.6 kB	665.0 kB	[list of files]