Package: r-bioc-annotationhub (3.12.0+dfsg-1)

[ Source: r-bioc-annotationhub  ]

GNU R-klient til at tilgå AnnotationHub-ressourcer

Denne pakke tilbyder en klient for Bioconductor AnnotationHub- internetressourcen. AnnotationHub-internetressourcen tilbyder en central lokation hvor genomiske filer (f.eks., VCF, bed, wig) og andre ressourcer fra standardlokationer (f.eks. UCSC, Ensembl) kan registreres. Ressourcen inkluderer metadata om hver ressource, f.eks., en tekstbeskrivelse, mærker og ændringsdato. Klienten opretter og håndtere et lokalt mellemlager med filer hentet af brugeren, hjælper med hurtig og reproducerbar adgang.

Other Packages Related to r-bioc-annotationhub

• dep: r-api-4.0

  virtual package provided by r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.19

  virtual package provided by r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-annotationdbi (>= 1.66.0)

  GNU R Annotation Database-grænseflade for BioConductor

• dep: r-bioc-biocfilecache (>= 2.12.0)

  GNU R management of files across sessions

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.50.0)

  Generiske funktioner for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocversion (>= 3.19.1)

  Angiv den passende version for Bioconductor-pakker

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.42.1)

  BioConductor S4-implementering af vektorer og lister

• dep: r-cran-biocmanager

  Tilgå pakkearkivet for Bioconductorprojektet

• dep: r-cran-curl

  GNU R modern and flexible web client for R

• dep: r-cran-dplyr

  GNU R-grammatik for datamanipulering

• dep: r-cran-httr

  GNU R-værktøjer for arbejdet med adresser og HTTP

• dep: r-cran-rappdirs

  GNU R application directories

• dep: r-cran-rsqlite

  Database Interface R-driver for SQLite

• dep: r-cran-yaml

  Methods to convert R data to YAML and back

• sug: r-bioc-biocstyle (>= 2.32.1)

  Standardstile for vignettes og andre Biocunductor-dokumenter

• sug: r-bioc-biostrings (>= 2.72.1)

  GNU R-strengobjekter der repræsenterer biologiske sekvenser

• sug: r-bioc-ensembldb (>= 2.28.0)

  GNU R-redskaber til at oprette og bruge en Ensembl-baseret annotationsdatabase

• sug: r-bioc-experimenthub (>= 2.12.0)

  BioConductor-klient til at tilgå ExperimentHub-ressourcer

• sug: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.40.1)

  BioConductor-redskaber til at manipulere kromosomidentifikatorer

• sug: r-bioc-genomicranges (>= 1.56.1)

  BioConductor-repræsentation og manipulation af genomiske intervaller

• sug: r-bioc-iranges (>= 2.38.1)

  GNU R - containere på lavt niveau til at lagre sæt af heltalsintervaller

• sug: r-bioc-rsamtools (>= 2.20.0)

  GNU R-binær sammenligning (BAM), variantkald (BCF) eller tabix-filimport

• sug: r-bioc-rtracklayer (>= 1.64.0)

  GNU R-grænseflade til genombrowsere og deres annotationsspor

• sug: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.34.0)

  BioConductor - assay-container

• sug: r-bioc-variantannotation (>= 1.50.0)

  BioConductor-annotation af genetiske varianter

• sug: r-cran-knitr

  GNU R-pakke for dynamisk rapportoprettelse via Literate Programming

• sug: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

• sug: r-cran-runit

  GNU R-pakke der tilbyder en ramme for enhedstest

Download r-bioc-annotationhub

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	434.7 kB	723.0 kB	[list of files]