Package: python3-loompy (3.0.7+dfsg-3)

[ Source: python-loompy  ]

Tilgå Loom-formaterede filer for bioinformatik

Loom er et effektivt filformat for meget store omics-datasæt, bestående af en hovedmatrix, eventuelle yderligere lag, et variabelt antal række- og kolonne-annotationer. Loom understøtter også rumlige grafer. Loom-filer bruges til at lagre enkelt celle genudtryksdata: hovedmatrixen indeholder de faktiske udtryksværdier (en kolonne per celle, en række per gen); række- og kolonne-annotationer indeholder metadata for gener og celler, såsom navn, kromosom, position (for gener), og stamme, køn, alder (for celler).

Loom-filer (.loom) oprettes i HDF5-filformatet, der understøtter en intern samling af numeriske flerdimensionelle datasæt. HDF5 er understøttet af mange computersprog, inklusive Java, MATLAB, Mathematica, Python, R og Julia. .loom-filer kan tilgås fra ethvert sprog, der understøtter HDF5.

Other Packages Related to python3-loompy

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: python3-click

  Oprettelsessæt for kommandolinjegrænsefladen - Python 3.x

• dep: python3-h5py

  Almene Pythongrænseflader til hdf5

• dep: python3-numba

  native machine code compiler for Python 3

• dep: python3-numpy

  Hurtig tabelfacilitet til Python 3-sproget

• dep: python3-numpy-groupies

  performs operations on/with subsets of n-dim arrays

• dep: python3-pandas

  Datastrukturer for »relationelle« data eller »etiketdata«

• dep: python3-pkg-resources

  Pakkesøgning og ressourceadgang med brug af pkg_resources

• dep: python3-scipy

  Videnskabelige værktøjer for Python 3

Download python3-loompy

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
ppc64el	39.9 kB	189.0 kB	[list of files]