Package: r-bioc-decontam (1.26.0+dfsg-2)

[ Source: r-bioc-decontam  ]

Identificer kontaminanter i markør-gen og metagenomiske sekventeringssata

Simpel statistisk identifikation af kontaminerende sekvenstræk i markør-gen eller metagenomiske data. Fungerer på enhver form for funktion afledt af miljøsekventeringsdata (f.eks. ASV'er, OTU'er, taksonomiske grupper, MAG'er,...). Kræver DNA-kvantificeringsdata eller sekventerede negative kontrolprøver.

Other Packages Related to r-bioc-decontam

• dep: r-api-4.0

  virtual package provided by r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.20

  virtual package provided by r-bioc-biocgenerics

• dep: r-cran-ggplot2 (>= 2.1.0)

  Implementering af Grammar of Graphics

• dep: r-cran-reshape2 (>= 1.4.1)

  Fleksibelt omdanne data - en genstart af pakken reshape

• sug: r-bioc-biocstyle

  Standardstile for vignettes og andre Biocunductor-dokumenter

• sug: r-bioc-phyloseq

  GNU R-håndtering og analyse af høj-gennemløb microbiome censusdata

• sug: r-cran-knitr

  GNU R-pakke for dynamisk rapportoprettelse via Literate Programming

• sug: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

Download r-bioc-decontam

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	205.9 kB	285.0 kB	[list of files]