Package: circlator (1.5.6-12)

[ Source: circlator  ]

Cirkularisere genomsamlinger

Circlator er et værktøj til at automatisere samlingscirkularisering for bakterielle og små eukaryote genomer og fremstille præcise lineære repræsentationer af cirkulære sekvenser.

Tags: Biology: Nucleic Acids, Field: Biology, field::biology:bioinformatics, implemented-in::python, Role: Program, Science: science::calculation, works-with::biological-sequence, Works with: Files

Other Packages Related to circlator

• dep: bwa

  Burrows-Wheeler Aligner (sekvenssammenligner)

• dep: canu

  Enkel molekyle sekvenssamler for genomer

• dep: fastaq

  Manipuleringsværktøjer til FASTA- og FASTQ-filer

• dep: mummer

  Effektiv sekvensjustering for hele genomer

• dep: prodigal

  Mikrobiel (bakteriel og archaeorganisme) genkonstateringsprogram

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: python3-openpyxl

  Python 3-modul til at læse/skrive OpenXML xlsx/xlsm-filer

• dep: python3-packaging

  Grundlæggende redskaber for Python 3-pakker

• dep: python3-pymummer

  Python 3-grænseflade til MUMmer

• dep: python3-pysam

  Grænseflade for SAM/BAM-sekvenssammenligning og oversættelsesformatet - Python 3

• dep: samtools

  Forarbejdning af sekvensopstillinger i SAM-, BAM- og CRAM-formater

• rec: spades

  Genomsamler for single-celle- og isolates-datasæt

Download circlator

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	4,496.3 kB	11,642.0 kB	[list of files]