all options
bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source: skewer  ]

Package: skewer (0.2.2-6 and others)

Links for skewer

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package skewer:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

Efterbehandling af høj-gennemløb DNA-sekvenslæsninger

Skewer implementerer den bit-maskede k-forskels matchende algoritme dedikeret til opgaven med adapter-tilpasning og den er specielt designet til at behandle næstegenerations sekventering (NGS) paired-end sekvenser.

Funktioner

 * Registrering og fjernelse af adaptersekvenser
 * Indsættelse og sletning tilladt i mønstermatchning
 * Målrettet læsningerne Single End, Paired End (PE) og Long Mate
   Pair (LMP)
 * Demultiplexing af stregkodede sekventeringsafviklinger
 * Tilpasning baseret på phred-kvalitetsbedømmelser
 * IUPAC-tegn for stregkoder og adaptere
 * Komprimeret understøttelse for inddata og uddata

Other Packages Related to skewer

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download skewer

Download for all available architectures
Architecture Version Package Size Installed Size Files
mips64el 0.2.2-6+b1 81.5 kB242.0 kB [list of files]