Package: r-cran-qtl (1.70-1)
Links for r-cran-qtl
Debian Resources:
Download Source Package r-cran-qtl:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [cran.r-project.org]
Similar packages:
GNU R-pakke for genetisk markørbindingsanalyse
R/QTL er et udvideligt, interaktivt miljø til kortlægning af kvantitativ trait loci (QTL'er) i eksperimentelle krydsninger. Det er implementeret som en udvidelsespakke til det frit tilgængelige og udbredte statistiske sprog/program R (se http://www.r-project.org).
Udviklingen af dette program som en udvidelse til R giver mulighed for at udnytte de grundlæggende matematiske og statistiske funktioner, og kraftfulde grafikfunktioner, der er indeholdt i R. Derudover vil brugeren få gavn af den problemfri integration af QTL-kortlægningsprogrammet i et generelt statistisk analyseprogram. Målet er at gøre komplekse QTL-kortlægningsmetoder bredt tilgængelige og give brugerne mulighed for at fokusere på modellering snarere end beregning.
Et centralt element i beregningsmæssige metoder til QTL-oversættelse er den skjulte Markov-modelteknologi (HMM) til håndtering af manglende arvemassedata. De vigtigste HMM-algoritmer blev implementeret, med hensyn til tilstedeværelsen af arvemassefejl, for tilbagekrydsninger, krydsninger og fase-kendte fire vejs krydsninger.
Den nuværende version af R/QTL omfatter faciliteter til estimering af genetiske kort, identificering af arvemassefejl, og udførelse af single-QTL-arvemasseskanninger og to-QTL, todimensionale arvemasse skanninger, efter intervalkortlægning (med EM-algoritmen), Haley-Knott-regression og flere imputationer. Alt dette kan udføres i nærvær af kovarianter (såsom køn, alder eller behandling). Man kan også passe højere orden QTL-modeller ved flere imputationer.
Other Packages Related to r-cran-qtl
|
|
|
|
-
- dep: libblas3
- Grundlæggende reference-implementeringer til lineær algebra, delt bibliotek
- or libblas.so.3
- virtual package provided by libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: liblapack3
- Bibliotek for lineære algebrarutiner 3 - delt version
- or liblapack.so.3
- virtual package provided by libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
-
- dep: r-api-4.0
- virtual package provided by r-base-core
-
- dep: ruby
- Fortolker af det objektorienterede skriptsprog Ruby - standardversion
-
- rec: r-cran-testthat
- GNU R-testpakke
Download r-cran-qtl
Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
---|---|---|---|
mips64el | 5,398.0 kB | 10,321.0 kB | [list of files] |