Package: r-bioc-genomicalignments (1.40.0-1)

[ Source: r-bioc-genomicalignments  ]

Bioconductor-repræsentation og manipulering af korte arvemassesammenligninger

Denne BioConductor-pakke tilbyder effektive containere til lagring og manipulering af korte avemassesammenligninger (typisk indhentet ved at sammenligne korte læsninger til en referencearvemasse). Dette inkluderer læsningsoptælling, beregning af dækning, knudepunktdetektering og arbejde med nukleotid indhold for sammenligningerne.

Other Packages Related to r-bioc-genomicalignments

• dep: libc6 (>= 2.4)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: r-api-4.0

  virtual package provided by r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.19

  virtual package provided by r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.50.0)

  Generiske funktioner for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocparallel (>= 1.38.0)

  BioConductor - faciliteter for parallel evulering

• dep: r-bioc-biostrings (>= 2.72.1)

  GNU R-strengobjekter der repræsenterer biologiske sekvenser

• dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.40.1)

  BioConductor-redskaber til at manipulere kromosomidentifikatorer

• dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.56.1)

  BioConductor-repræsentation og manipulation af genomiske intervaller

• dep: r-bioc-iranges (>= 2.38.1)

  GNU R - containere på lavt niveau til at lagre sæt af heltalsintervaller

• dep: r-bioc-rsamtools (>= 2.20.0)

  GNU R-binær sammenligning (BAM), variantkald (BCF) eller tabix-filimport

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.42.1)

  BioConductor S4-implementering af vektorer og lister

• dep: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.34.0)

  BioConductor - assay-container

• sug: r-bioc-biocstyle (>= 2.32.1)

  Standardstile for vignettes og andre Biocunductor-dokumenter

• sug: r-bioc-bsgenome (>= 1.72.0)

  BioConductor-infrastruktur for Biostrings-baserede arvemassepakker

• sug: r-bioc-deseq2 (>= 1.44.0)

  R-pakke for RNS-Seq-differentiel udtryksanalyse

• sug: r-bioc-edger (>= 4.2.0)

  Empirisk analyse af digitale gen-udtryksdata i R

• sug: r-bioc-genomicfeatures (>= 1.56.0)

  GNU R-værktøjer til at lave og manipulere transcript centric-annotationer

• sug: r-bioc-rtracklayer (>= 1.64.0)

  GNU R-grænseflade til genombrowsere og deres annotationsspor

• sug: r-bioc-shortread (>= 1.62.0)

  GNU R - klasser og metoder for høj-gennemløb kort-læsning sekventeringsdata

• sug: r-cran-knitr

  GNU R-pakke for dynamisk rapportoprettelse via Literate Programming

• sug: r-cran-runit

  GNU R-pakke der tilbyder en ramme for enhedstest

Download r-bioc-genomicalignments

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
mips64el	2,107.1 kB	3,453.0 kB	[list of files]