Package: libbio-db-hts-perl (3.01-5)

[ Source: libbio-db-hts-perl  ]

Perlgrænseflade til HTS-biblioteket

HTSlib er en implementering af et ensartet C-bibliotek for adgang til fælles filformater, såsom SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM og VCF (Variant Call Format), brugt for sekvensdata med høj gennemløb, og er basisbiblioteket brugt af samtools og bcftools. HTSlib afhænger kun af zlib. Det vides at være kompatibelt med gcc, g++ og clang.

HTSlib implementerer et generelt BAM-indeks (binær SAM), med filendelsen »csi« (coordinate-sorted index). HTSlib-fillæseren kigger først efter det nye indeks og så efter det gamle, hvis det nye indeks mangler.

Denne pakke tilbyder en Perlgrænseflade til HTS-biblioteket.

Other Packages Related to libbio-db-hts-perl

• dep: libbio-perl-perl

  BioPerl - grundlæggende Perlmoduler

• dep: libc6 (>= 2.4)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C-bibliotek for høj-gennemløb sekvensdataformater

• dep: perl (>= 5.40.0-6)

  Larry Walls praktiske uddragnings- og rapportsprog (Perl)

• dep: perlapi-5.40.0

  virtual package provided by perl-base

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

Download libbio-db-hts-perl

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
mips64el	129.6 kB	548.0 kB	[list of files]