Package: hyphy-mpi (2.5.62+dfsg-1 and others) [debports]

[ Source:  ]

Hypotesetest ved hjælp af fylogenier - MPI-version

HyPhy er en programpakke, udviklet i åben kildekode, til analyse af genetiske sekvenser ved hjælp af teknikker i fylogeni, molekylær evolution og maskinlæring. Den er udstyret med en komplet grafisk brugergrænseflade (GUI) og et rigt skriptsprog for grænseløs tilpasning af analyser. Derudover har Hyphy funktioner til støtte for parallelle beregningsmiljøer (via en beskedfortolkningsgrænseflade) og kan kompileres som et delt bibliotek og kaldes fra andre programmeringsmiljøer såsom Python eller R. Fortsat udvikling af Hyphy er i øjeblikket delvist understøttet af en NIGMS R01 award 1R01GM093939.

Denne pakke indeholder en kørbar fil via MPI til brug af flere processorer.

Other Packages Related to hyphy-mpi

• dep: hyphy-common (= 2.5.62+dfsg-1)

  Hypotesetest ved hjælp af fylogenier - fælles filer

• dep: libc6 (>= 2.38)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libcurl3t64-gnutls (>= 7.16.2)

  Simpelt adresseoverførelsesbibliotek for klientsiden - GnuTLS-variant

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1)

  GCC støttebibliotek

• dep: libgomp1 (>= 6)

  GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)

• dep: libmpich12 (>= 4.2.0)

  Shared libraries for MPICH

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  Delt bibliotek til SQLite 3

• dep: libstdc++6 (>= 5)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.11.dfsg)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

Download hyphy-mpi

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
m68k (unofficial port)	2.5.62+dfsg-1+b1	755.9 kB	2,352.0 kB	[list of files]