Package: libfreecontact-perl (0.08-9 and others)

[ Source: libfreecontact-perl  ]

Hurtig protein-kontaktprædiktor - binding for Perl

FreeContact er en protein-kontaktrestprædiktor optimeret til hastighed. Dens indgang er en flersekvensopstilling. FreeContact kan fungere som en accelereret erstatning for de offentliggjorte kontaktprædiktorer EVfold-mfDCA af DS. Marks (2011) og PSICOV af D. Jones (2011).

FreeContact accelereres af en kombination af vektorinstruktioner, flere tråde og hurtigere gennemførelse af centrale dele. Afhængig af opstillingen er 8-fold eller højere hastighedsforøgelser mulige.

En tilstrækkelig stor tilpasning er påkrævet for meningsfulde resultater. Som minimum bør en opstilling med et effektivt (efter-vægtning) sekvensantal større end længden af søgesekvensen anvendes. Opstillinger med titusinder af (effektive) sekvenser betragtes som gode inddata.

Jackhmmer(1) fra hmmer-pakken eller hhblits(1) fra hhsuite kan anvendes til at oprette opstillingerne, f.eks.

Denne pakke indeholder Perlbindingen.

Tags: Software Development: Perl Development, Libraries, Implemented in: implemented-in::c, implemented-in::perl, Role: Development Library

Other Packages Related to libfreecontact-perl

• dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, ia64, sh4]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libfreecontact0t64 (>= 1.0.21) [not alpha]

  Hurtig protein-kontaktprædiktor - bibliotek

• dep: libfreecontact0v5 (>= 1.0.21) [alpha]

  Hurtig protein-kontaktprædiktor - bibliotek

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

  GCC støttebibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC støttebibliotek

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC støttebibliotek

• dep: libunwind8 [ia64]

  Bibliotek til at bestemme call-chain for et program - kørselstid

• dep: perl (>= 5.36.0-7) [alpha]

  Larry Walls praktiske uddragnings- og rapportsprog (Perl)

  dep: perl (>= 5.38.2-3.2) [ia64]

  dep: perl (>= 5.40.0-6) [not alpha, ia64]

• dep: perlapi-5.36.0 [alpha]

  virtual package provided by perl-base

• dep: perlapi-5.38.2 [ia64]

  virtual package provided by perl-base

• dep: perlapi-5.40.0 [not alpha, ia64]

  virtual package provided by perl-base

Download libfreecontact-perl

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	0.08-9+b1	62.4 kB	226.0 kB	[list of files]
amd64	0.08-9+b5	62.3 kB	209.0 kB	[list of files]
arm64	0.08-9+b5	60.5 kB	225.0 kB	[list of files]
armel	0.08-9+b5	61.0 kB	204.0 kB	[list of files]
armhf	0.08-9+b5	59.8 kB	192.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	0.08-9+b5	63.0 kB	213.0 kB	[list of files]
i386	0.08-9+b5	62.5 kB	216.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	0.08-9+b4	64.7 kB	258.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	0.08-9+b5	62.1 kB	216.0 kB	[list of files]
mips64el	0.08-9+b5	59.7 kB	226.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	0.08-9+b5	61.9 kB	225.0 kB	[list of files]
ppc64el	0.08-9+b5	61.9 kB	225.0 kB	[list of files]
riscv64	0.08-9+b3	61.1 kB	196.0 kB	[list of files]
s390x	0.08-9+b5	62.2 kB	209.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	0.08-9+b6	64.3 kB	224.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	0.08-9+b5	60.1 kB	1,186.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	0.08-9+b5	62.6 kB	208.0 kB	[list of files]