Package: libfreecontact-dev (1.0.21-14 and others)
Links for libfreecontact-dev
Debian Resources:
Download Source Package freecontact:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [rostlab.org]
Similar packages:
Hurtig protein-kontaktprædiktorbibliotek - udviklingsfiler
FreeContact er en protein-kontaktrestprædiktor optimeret til hastighed. Dens indgang er en flersekvensopstilling. FreeContact kan fungere som en accelereret erstatning for de offentliggjorte kontaktprædiktorer EVfold-mfDCA af DS. Marks (2011) og PSICOV af D. Jones (2011).
FreeContact accelereres af en kombination af vektorinstruktioner, flere tråde og hurtigere gennemførelse af centrale dele. Afhængig af opstillingen er 8-fold eller højere hastighedsforøgelser mulige.
En tilstrækkelig stor tilpasning er påkrævet for meningsfulde resultater. Som minimum bør en opstilling med et effektivt (efter-vægtning) sekvensantal større end længden af søgesekvensen anvendes. Opstillinger med titusinder af (effektive) sekvenser betragtes som gode inddata.
Jackhmmer(1) fra hmmer-pakken eller hhblits(1) fra hhsuite kan anvendes til at oprette opstillingerne, f.eks.
Denne pakke indeholder filer nødvendige for udvikling af programmer med libfreecontact.
Packages providing libfreecontact-dev
- libfreecontact-dev
- Hurtig protein-kontaktprædiktorbibliotek - udviklingsfiler
Other Packages Related to libfreecontact-dev
|
|
|
|
-
- dep: libfreecontact0t64 (= 1.0.21-13.1+b1) [ia64]
- Hurtig protein-kontaktprædiktor - bibliotek
- dep: libfreecontact0t64 (= 1.0.21-14) [not ia64]
-
- sug: libfreecontact-doc
- Dokumentation for libfreecontact
Download libfreecontact-dev
| Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|---|
| alpha (unofficial port) | 1.0.21-14 | 89.6 kB | 420.0 kB | [list of files] |
| amd64 | 1.0.21-14 | 89.9 kB | 351.0 kB | [list of files] |
| arm64 | 1.0.21-14 | 83.6 kB | 332.0 kB | [list of files] |
| armel | 1.0.21-14 | 74.7 kB | 298.0 kB | [list of files] |
| armhf | 1.0.21-14 | 74.6 kB | 261.0 kB | [list of files] |
| hppa (unofficial port) | 1.0.21-14 | 100.0 kB | 398.0 kB | [list of files] |
| i386 | 1.0.21-14 | 76.5 kB | 276.0 kB | [list of files] |
| ia64 (unofficial port) | 1.0.21-13.1+b1 | 108.7 kB | 494.0 kB | [list of files] |
| m68k (unofficial port) | 1.0.21-14 | 67.3 kB | 261.0 kB | [list of files] |
| mips64el | 1.0.21-14 | 82.8 kB | 365.0 kB | [list of files] |
| ppc64 (unofficial port) | 1.0.21-14 | 85.9 kB | 351.0 kB | [list of files] |
| ppc64el | 1.0.21-14 | 97.1 kB | 360.0 kB | [list of files] |
| riscv64 | 1.0.21-14 | 215.0 kB | 1,964.0 kB | [list of files] |
| s390x | 1.0.21-14 | 78.7 kB | 338.0 kB | [list of files] |
| sh4 (unofficial port) | 1.0.21-14 | 89.0 kB | 254.0 kB | [list of files] |
| sparc64 (unofficial port) | 1.0.21-14 | 73.0 kB | 331.0 kB | [list of files] |
| x32 (unofficial port) | 1.0.21-14 | 89.8 kB | 303.0 kB | [list of files] |