Package: r-bioc-biomart (2.60.1+dfsg-1)

[ Source: r-bioc-biomart  ]

GNU R Interface til BioMart-databsaer (Ensembl, COSMIC, Wormbase og Gramene)

I de senere år er en rigdom af biologiske data blevet tilgængelige i offentlige dataarkiver. Nem adgang til disse værdifulde dataressourcer og sikker integration med dataanalyse er krævet for omfattende dataanalyse indenfor bioinformatik. BiomaRt tilbyder en grænseflade til en voksende samling af databaser, der implementerer programpakken BioMart (http://www.biomart.org). Pakken aktiverer indhentelse af store mængder data på en ensartet måde uden behov for at kende de underliggende databaseskemaer eller skrive komplekse SQL-forespørgsler. Eksempler på BioMart-databaser er Ensembl, COSMIC, Uniprot, HGNC, Gramene, Wormbase og dbSNP oversat til Ensembl. Disse væsentlige databaser giver biomaRt-brugere direkte adgang til et bredt sæt af data og aktiverer en bred vifte af funktionsrige forespørgsler fra gen-annotation til databaseundersøgelser.

Other Packages Related to r-bioc-biomart

• dep: r-api-4.0

  virtual package provided by r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.19

  virtual package provided by r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-annotationdbi (>= 1.66.0)

  GNU R Annotation Database-grænseflade for BioConductor

• dep: r-bioc-biocfilecache (>= 2.12.0)

  GNU R management of files across sessions

• dep: r-cran-digest

  GNU R package for 'hash digest' of R data structures

• dep: r-cran-httr2

  perform HTTP requests and process the responses in GNU R

• dep: r-cran-progress

  GNU R - statusbjælker for terminalen

• dep: r-cran-rappdirs

  GNU R application directories

• dep: r-cran-stringr

  Gør det nemmere at arbejde med strenge

• dep: r-cran-xml2

  GNU R XML-fortolker

• sug: r-bioc-biocstyle (>= 2.32.1)

  Standardstile for vignettes og andre Biocunductor-dokumenter

• sug: r-cran-httptest2

  Test Helpers for 'httr2'

• sug: r-cran-knitr

  GNU R-pakke for dynamisk rapportoprettelse via Literate Programming

• sug: r-cran-mockery

  mocking library for GNU R

• sug: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

• sug: r-cran-testthat

  GNU R-testpakke

Download r-bioc-biomart

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	441.3 kB	632.0 kB	[list of files]