Package: resfinder (4.4.2-1)
Links for resfinder
Debian Resources:
Download Source Package resfinder:
- [resfinder_4.4.2-1.dsc]
- [resfinder_4.4.2.orig-debian-tests-data.tar.xz]
- [resfinder_4.4.2.orig.tar.xz]
- [resfinder_4.4.2-1.debian.tar.xz]
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [bitbucket.org]
Similar packages:
Identificer erhvervede antimikrobielle resistensgener
ResFinder identificerer erhvervede antimikrobielle resistensgener i alt eller delvise sekventerede isolater af bakterier.
ResFinder der bruger BLAST til identifikation af erhvervede antimikrobielle resistensgener i whole-genome-data. Som data kan metoden bruge både genomer samlet på forhånd, fuldstændige genomer eller delvise genomer, og korte sekvenslæsninger fra fire forskellige sekventeringsplatforme. Metoden blev evalueret på 1.862 GenBank-filer indeholdende 1.411 forskellige resistensgener, samt på 23 de-novo-sekventerede isolater.
Other Packages Related to resfinder
|
|
|
|
-
- dep: kma
- Sammenlign genomsekvenser med rå læsninger direkte mod redundante databaser
-
- dep: ncbi-blast+-legacy
- NCBI Blast-forældet kaldskript
-
- dep: python3
- Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3
-
- dep: python3-cgecore
- Python 3-modul for Center for Genomic Epidemiology
-
- dep: python3-cgelib
- Python 3-kode til udnyttelse på tværs af CGE-værktøjer
-
- dep: python3-dateutil
- Funktionsrige udvidelser til Python 3's standardmodul datetime
-
- dep: python3-git
- Pythonbibliotek til at interagere med Git-arkiver
-
- dep: python3-tabulate
- Forskønnede tabulære data i Python 3
-
- dep: resfinder-db
- ResFinder-databasen er en kurateret database for erhvervede resistensgener
Download resfinder
Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
---|---|---|---|
all | 66.3 kB | 402.0 kB | [list of files] |