Package: hmmer (3.4+dfsg-2)

[ Source: hmmer  ]

Profilskjulte Markov-modeller for proteinsekvensanalyse

HMMER er en implementering af profilskjulte Markov-modelmetoder for sensitive søgninger i biologiske sekvensdatabaser med brug af flersekvensjusteringer som forespørgsler.

Givet en flersekvensjustering som input, bygger HMMER en statistisk model kaldt »skjult Markovmodel«, som kan bruges som en forespørgsel ind i en sekvensdatabase for at finde (og/eller justere) yderligere homologier for sekvensfamilien.

Tags: Biology: Clustal/ALN, Proteins, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::searching, works-with-format::plaintext, Works with: Databases

Other Packages Related to hmmer

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libdivsufsort3 (>= 2.0.1)

  Hurtig suffiks-tabelkonstruktion

• sug: hmmer-doc (>= 3.4+dfsg-2)

  Profilskjulte Markov-modeller for proteinsekvensanalyse - dokumentation

Download hmmer

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
i386	1,068.1 kB	6,187.0 kB	[list of files]