[ Source: ampliconnoise ]
Package: ampliconnoise (1.29-13)
Links for ampliconnoise
Debian Resources:
Download Source Package ampliconnoise:
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Tim Booth (QA Page)
- Andreas Tille (QA Page)
- Pranav Ballaney (QA Page)
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
Fjernelse af støj fra 454-sekvenserede PCR-amplicons
AmpliconNoise er en pakke af programmer til at rydde op i sekvensdata med høj gennemløb. Den består af tre hoveddele:
Pyronoise - udfører flowgram-baseret klyngedannelse for at finde
fejllæsninger
SeqNoise - fjerner PCR-punktmutationer
Perseus - fjerner PCR-chimeras uden behov for at et sæt af
referencesekvenser
Tidligere var der en uafhængig »Pyronoise« af de samme forfattere og denne pakke inkluderer en opdateret version. Der er også en »Denoiser« i Qiime, som er relateret men distinkt.
Other Packages Related to ampliconnoise
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libgsl28 (>= 2.8+dfsg)
- GNU Scientific Library (GSL) - bibliotekspakke
-
- dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6)
- Bibliotek til beskedvideresendelse med høj ydelse - delt bibliotek
-
- dep: mafft
- Program til justering af flere aminosyrer eller nukleotide sekvenser
-
- rec: openmpi-bin
- Bibliotek til beskedvideresendelse med høj ydelse - binære filer
Download ampliconnoise
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| i386 | 1,074.4 kB | 2,012.0 kB | [list of files] |