Package: ncbi-entrez-direct (6.90.20170705+ds-2) [debports]

[ Source:  ]

NCBI Entrez-redskaber på kommandolinjen

Entrez Direct (EDirect) er en avanceret metode til at tilgå NCBI's sæt af forbundne databaser (udgivelse, sekvens, struktur, gen, variation, udtryk etc.) fra et terminalvindue eller et skript. Funktioner anvender søgetermer fra kommandolinjeargumenter. Individuelle operationer kombineres til at bygge forespørgsler i flere trin. Postindhentelse og formatering fuldender normalt processen.

EDirect tilbyder også en funktion drevet af argumenter, der forenkler udtrækningen af data fra dokumentresume eller andre resultater, der returneres i struktureret XML-format. Dette kan eliminere behovet for at skrive tilpassede programmer for at besvare ad hoc-spørgsmål. Forespørgsler kan flytte problemfrit mellem EDirect-kommandoer og UNIX-redskaber eller skripter for at udføre handlinger, der ikke kan opnås helt i Entrez.

Other Packages Related to ncbi-entrez-direct

• dep: libwww-perl

  simpel og konsistent grænseflade til World Wide Web

• dep: perl

  Larry Walls praktiske uddragnings- og rapportsprog (Perl)

Download ncbi-entrez-direct

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
hppa (unofficial port)	62.3 kB	290.0 kB	[list of files]