Package: bppsuite (2.4.1-7 and others)

[ Source: bppsuite  ]

Programpakke for Bio++

Programpakken Bio++ er en programpakke, som bruger Bio++-bibliotekerne og er dedikeret til fylogenetisk og molekylær evolution. Alle programmer er uafhængige, men kan kombineres for at udføre komplekse analyser. Disse programmer bruger hjælpeværktøjerne for grænsefladen for bibliotekerne, og dermed dele den samme syntaks. De har også flere indstillinger til fælles, som også kan deles af tredjepartsprogrammer.

De følgende programmer er inkluderet:

 - BppML til analyse af maksimal sandsynlighed
 - BppSeqGen til simulering af sekvenser
 - BppAncestor til rekonstruktion af tidligere tilstande
 - BppDist til afstandsmetoder
 - BppPars til analyse af parsimoni (sparsommelighed)
 - BppSeqMan til filkonvertering og manipulation af sekvenser
 - BppConsense til at bygge af konsensustræ og beregning af
   opstartsværdier
 - BppDist for afstandsmetoder
 - BppReRoot til gendannelse af træer rødder
 - BppTreeDraw til tegning af træer
 - BppAlnScore til sammenligning af justering og beregning af point for
   justeringer
 - BppMixedLikelihoods til beregning af per side ensartethed for
   komponenter for mixture-modeller
 - BppPopGen til befolkning af genetiske analyser

Other Packages Related to bppsuite

• dep: libbpp-core4t64 (>= 2.4.1)

  Bio++ Core-bibliotek

• dep: libbpp-phyl12t64 (>= 2.4.1)

  Bio++ Phylogentic-bibliotek

• dep: libbpp-popgen8t64 (>= 2.4.1)

  Bio++ Population Genetics-bibliotek

• dep: libbpp-seq12t64 (>= 2.4.1)

  Bio++ Sequence-bibliotek

• dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, ia64, sh4]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC støttebibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC støttebibliotek

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC støttebibliotek

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [not alpha]

  GNU Standard C++ bibliotek v3

  dep: libstdc++6 (>= 14-20240221-2.1) [alpha]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Bibliotek til at bestemme call-chain for et program - kørselstid

• sug: bppsuite-examples

  Eksempler for Bio++-programpakken

Download bppsuite

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	2.4.1-7	372.9 kB	2,439.0 kB	[list of files]
amd64	2.4.1-7	379.9 kB	2,002.0 kB	[list of files]
arm64	2.4.1-7+b1	355.6 kB	2,423.0 kB	[list of files]
armel	2.4.1-7	321.6 kB	1,606.0 kB	[list of files]
armhf	2.4.1-7	328.6 kB	1,326.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	2.4.1-7	391.4 kB	2,024.0 kB	[list of files]
i386	2.4.1-7	386.4 kB	1,830.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	2.4.1-7	386.9 kB	2,965.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	2.4.1-7	367.7 kB	1,794.0 kB	[list of files]
mips64el	2.4.1-7	346.9 kB	2,606.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	2.4.1-7	380.2 kB	2,806.0 kB	[list of files]
ppc64el	2.4.1-7	376.2 kB	2,614.0 kB	[list of files]
riscv64	2.4.1-7	363.1 kB	1,670.0 kB	[list of files]
s390x	2.4.1-7	359.2 kB	1,994.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	2.4.1-7	402.9 kB	2,166.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	2.4.1-7	332.2 kB	12,453.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	2.4.1-7	377.5 kB	1,742.0 kB	[list of files]