Package: yaha (0.1.83-3)

[ Source: yaha  ]

Find split-read-oversættelser på single-end-forespørgsler

Yaha er en fleksibel, sensitiv og præcis DNA-sammenligner designet for single-end-læsninger. Programmet understøtter tre major-tilstande:

 * Standardtilstanden »Optimal Query Coverage« (-OQC) rapporterer
   det bedste sæt af sammenligninger som dækker længden af hver
   forespørgsel
 * Brug af »Filter By Similarity« (-FBS), sammen med det bedste sæt af
   sammenligninger, vil også vise sammenligninger som er meget lig en
   sammenligning i det bedste sæt
 * Endelig kan yaha vise alle sammenligninger fundet for hver
   forespørgsel

-OQC- og -FBS-tilstande er specifikt finjusteret til at forme split- læsningsoversættelser, som kan bruges til præcist at identificere strukturelle variationshændelser (sletninger, duplikeringer, indsættelser eller inversioner) mellem emneforespørgslen og referencegenomet.

Other Packages Related to yaha

• dep: libc6 (>= 2.4)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.5)

  GCC støttebibliotek

Download yaha

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
armel	36.1 kB	92.0 kB	[list of files]