Package: r-bioc-rtracklayer (1.64.0-1)

[ Source: r-bioc-rtracklayer  ]

GNU R-grænseflade til genombrowsere og deres annotationsspor

Udvidelig ramme for interaktion med flere genombrowsere (i øjeblikket UCSC indbygget) og manipulering af annotationsspor i diverse formater (i øjeblikket GFF, BED, bedGraph, BED15, WIG, BigWig og 2bit indbygget). Brugeren kan eksportere/importere spor til/fra de understøttede browsere, samt forespørge og ændre browsertilstanden, såsom den nuværende viewport.

Other Packages Related to r-bioc-rtracklayer

• dep: libc6 (>= 2.38)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libcurl4t64 (>= 7.16.2)

  nemt at bruge adresseoverførelsesbibliotek for klientsiden (OpenSSL-variant)

• dep: libssl3t64 (>= 3.0.0)

  Secure Sockets Layer-værktøjssæt - delte biblioteker

• dep: r-api-4.0

  virtual package provided by r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.19

  virtual package provided by r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.50.0)

  Generiske funktioner for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocio (>= 1.14.0)

  standard input and output for Bioconductor packages

• dep: r-bioc-biostrings (>= 2.72.1)

  GNU R-strengobjekter der repræsenterer biologiske sekvenser

• dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.40.1)

  BioConductor-redskaber til at manipulere kromosomidentifikatorer

• dep: r-bioc-genomicalignments (>= 1.40.0)

  Bioconductor-repræsentation og manipulering af korte arvemassesammenligninger

• dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.56.1)

  BioConductor-repræsentation og manipulation af genomiske intervaller

• dep: r-bioc-iranges (>= 2.38.1)

  GNU R - containere på lavt niveau til at lagre sæt af heltalsintervaller

• dep: r-bioc-rsamtools (>= 2.20.0)

  GNU R-binær sammenligning (BAM), variantkald (BCF) eller tabix-filimport

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.42.1)

  BioConductor S4-implementering af vektorer og lister

• dep: r-bioc-xvector (>= 0.44.0)

  BioConductor-repræsentation og manipulering af eksterne sekvenser

• dep: r-bioc-zlibbioc (>= 1.50.0)

  (Virtuel) zlibbioc - Bioconductor-pakke

• dep: r-cran-curl

  GNU R modern and flexible web client for R

• dep: r-cran-httr

  GNU R-værktøjer for arbejdet med adresser og HTTP

• dep: r-cran-restfulr (>= 0.0.13)

  GNU R-grænseflade til RESTful-internettjenester

• dep: r-cran-xml (>= 1.98-0)

  GNU R-pakke for XML-fortolkning og oprettelse

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

• sug: r-bioc-bsgenome (>= 1.72.0)

  BioConductor-infrastruktur for Biostrings-baserede arvemassepakker

• sug: r-bioc-genefilter (>= 1.86.0)

  Metoder for filtrering af gener fra microarray-eksperimenter

• sug: r-bioc-genomicfeatures (>= 1.56.0)

  GNU R-værktøjer til at lave og manipulere transcript centric-annotationer

• sug: r-bioc-limma (>= 3.60.3)

  Lineære modeller for microarray-data

• sug: r-bioc-org.hs.eg.db (>= 3.19.1)

  Genom-bred annotation for mennesker

• sug: r-cran-runit

  GNU R-pakke der tilbyder en ramme for enhedstest

Download r-bioc-rtracklayer

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
arm64	4,932.5 kB	6,597.0 kB	[list of files]