Package: q2-quality-control (2024.5.0-1)

[ Source: q2-quality-control  ]

QIIME 2-udvidelsesmodul for kvalitetssikkerhed i funktions- og sekvensdata

QIIME 2 er en funktionsrig og decentraliseret mikrobiome analysepakke med fokus på data og analysegennemsigtighed. QIME 2 gør det muligt for forskere at starte en analyse med rå DNA-sekvensdata og afslutte med figurer og statistiske resultater i udgivelseskvalitet. Nøglefunktioner:

 * Integreret og automatisk registrering af dataherkomst
 * Semantisk typesystem
 * Udvidelsesmodulsystem for udvidelse af mikrobiome analysefunktionalitet
 * Understøttelse for flere typer af brugerflader (f.eks. API,
   kommandolinjen, grafisk)

QIIME 2 er et fuldstændigt nyt design og omskrivning af QIIME 1 mikrobiome analysedatakanalen. QIIME 2 vil adressere mange af begrænsningerne i QIIME 1, men de funktioner der gør QIIME 1 til en funktionsrig og bredt anvendt analysedatakanal bevares.

QIIME 2 understøtter i øjeblikket en oprindelig start til slut-mikrobiome analysedatakanal. Ny funktionalitet vil blive tilgængelig via QIIME 2-udvidelsesmoduler. Du kan se en liste over tilgængelige udvidelsesmoduler på QIIME 2's side over udvidelsesmoduler. »future«-siden viser udvidelsesmoduler under udvikling.

Other Packages Related to q2-quality-control

• dep: bowtie2

  Ultrahurtig og hukommelseseffektiv short read-sammenligner

• dep: ncbi-blast+

  Næste generation programpakke for BLAST-sekvens søgeværktøjer

• dep: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

• dep: python3-biom-format

  Biological Observation Matrix-format (BIOM) - Python 3

• dep: python3-h5py

  Almene Pythongrænseflader til hdf5

• dep: python3-numpy

  Hurtig tabelfacilitet til Python 3-sproget

• dep: python3-pandas

  Datastrukturer for »relationelle« data eller »etiketdata«

• dep: python3-scipy (>= 1.10~)

  Videnskabelige værktøjer for Python 3

• dep: python3-seaborn

  Statistisk visualiseringsbibliotek for Python 3

• dep: q2-taxa (>= 2024.5)

  QIIME 2-udvidelsesmodul for arbejdet med funktionstaksonomiannotationer

• dep: q2templates (>= 2024.5)

  Designskabelonpakke for QIIME 2-udvidelsesmoduler

• dep: qiime (>= 2024.5)

  Kvantitativ indsigt i mikrobiel økologi

• dep: r-base-core

  GNU R-kerne af statistisk beregning og grafiksystem

• dep: r-bioc-decontam

  identify contaminants in marker-gene and metagenomics sequencing sata

• dep: r-cran-optparse

  GNU/R-fortolker for kommandolinjetilvalg

• dep: samtools

  Forarbejdning af sekvensopstillinger i SAM-, BAM- og CRAM-formater

• dep: vsearch

  Værktøj til behandling af metagenomiske sekvenser

Download q2-quality-control

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	711.5 kB	3,746.0 kB	[list of files]