Package: snakemake (7.32.4-6)

[ Source: snakemake  ]

Pythonisk system for håndtering af arbejdsforløb

Byggesystemer såsom GNU Make bruges ofte til at oprette komplicerede arbejdsforløb, f.eks. i bioinformatik. Dette projekt forsøger at reducere kompleksiteten ved oprettelse af arbejdsforløb ved at tilbyde et rent og moderne domænespecifikt sprog (DSL) i Pythonstil, sammen med et hurtig og komfortabelt kørselsmiljø.

Other Packages Related to snakemake

• dep: ca-certificates

  Fælles CA-certifikater

• dep: libjs-bootstrap

  HTML, CSS og JS-ramme

• dep: libjs-jquery

  JavaScript-bibliotek for dynamiske internetprogrammer

• dep: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

• dep: python3-configargparse

  Erstatning for argparse med konfigurationsfiler og miljøvariabler

• dep: python3-connection-pool

  Trådsikker forbindelsespulje for Python 3

• dep: python3-datrie

  Super-fast, efficiently stored Trie for Python 3

• dep: python3-docutils

  Tekstbehandlingssystem for reStructuredText - implementeret i Python 3

• dep: python3-git

  Pythonbibliotek til at interagere med Git-arkiver

• dep: python3-humanfriendly

  Python 3-bibliotek til at lave brugervenlige tekstgrænseflader

• dep: python3-jinja2 (>= 3.0~)

  Lille men hurtigt og letanvendelig enkeltstående skabelon-generator

• dep: python3-jsonschema

  Endnu en implementering af JSON Schema

• dep: python3-nbformat

  Jupyter-notesbogformat - Python 3

• dep: python3-packaging

  Grundlæggende redskaber for Python 3-pakker

• dep: python3-platformdirs

  determining appropriate platform-specific directories (Python 3)

• dep: python3-psutil

  Modul der tilbyder nemme funktioner til at håndtere processer - Python 3

• dep: python3-pulp (>= 2.0~)

  LP modeler - Python 3.x

• dep: python3-ratelimiter

  Simpelt Pythonbibliotek til at begrænse mængden for operationer

• dep: python3-requests

  Elegant og simpelt HTTP-bibliotek for Python3, bygget for mennesker

• dep: python3-retry

  Nem anvendelig prøv igen-dekoratør

• dep: python3-smart-open (>= 3.0~)

  utils for streaming large files

• dep: python3-stopit

  Kontroldekoratør for tidsudløb og kontekststyring for Python 3

• dep: python3-tabulate

  Forskønnede tabulære data i Python 3

• dep: python3-throttler

  Nem throttlig med ayncio-understøttelse for Python 3

• dep: python3-toposort

  Topologisk sorteringsalgoritme - Python 3-modul

• dep: python3-wrapt

  Dekoratører, omslag og »monkey patching« - Python 3.x

• dep: python3-yaml

  YAML-fortolker og udleder for Python 3

• dep: python3-yte

  YAML template engine with Python expressions

• rec: cwltool

  Common Workflow Language - referenceimplementering

• rec: imagemagick

  Programmer til billedmanipulering - binære filer
  also a virtual package provided by graphicsmagick-imagemagick-compat, imagemagick-6.q16, imagemagick-7.q16

• rec: python3-azure-storage

  Microsoft Azure Storage Library for Python 3.x

• rec: python3-biopython

  Python 3-bibliotek for bioinformatik

• rec: python3-boto3

  Pythongrænseflade til Amazons nettjenester - Python 3.x

• rec: python3-botocore

  Datadrevet kerne af boto 3 på lavt niveau - Python 3

• rec: python3-dropbox

  Official Dropbox API Client (Python3 version)

• rec: python3-flask

  Mikronetramme baseret på Werkzeug og Jinja2 - Python 3.x

• rec: python3-ftputil

  high-level FTP client library for Python

• rec: python3-irodsclient

  Klient-API for iRods

• rec: python3-kubernetes

  Kubernetes Python-klient - Python 3.x

• rec: python3-pygments

  Syntaksfremhævelsespakke skrevet i Python 3

• rec: python3-tz

  Python3-version af tidszonedatabasen Olson

• rec: python3-urllib3

  HTTP-bibliotek med trådsikker forbindelsespooling for Python 3

• rec: python3-yappi

  Endnu et Python-profileringsprogram - Python 3.x

• sug: slurm-client

  Slurm - kommandoer for klientsiden

• sug: snakemake-doc

  Dokumentation for pythonisk system til arbejdsforløb

Download snakemake

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	310.3 kB	1,560.0 kB	[list of files]