Package: quorum (1.1.2-2)

[ Source: quorum  ]

QUality Optimized Reads of genomic sequences

QuorUM giver mulighed for at opnå trimmede og fejlkorrigerede læsninger, der resulterer i samlinger med længere contigs og færre fejl. QuorUM giver bedst ydeevne sammenlignet med andre offentliggjorte fejlkorrektorer i flere målinger. QuorUM implementeres effektivt ved at benytte nuværende multi-kerne beregningsarkitekturer, og den er velegnet til store datasæt (1 milliarder baser kontrolleres og korrigeres pr. dag pr. kerne). Tredjepartsassembleren (SOAPdenovo) har signifikant fordel af at bruge QuorUM-fejlkorrigerede læsninger. QuorUM-fejlkorrigerede læsninger resulterer i en faktor på 1,1 til 4 i forbedring i N50-contigstørrelse sammenlignet med de oprindelige læsninger med SOAPdenovo for de undersøgte datasæt.

Other Packages Related to quorum

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  GCC støttebibliotek

• dep: libjellyfish-2.0-2 (>= 2.3.0)

  Tæl k-mers i DNA-sekvenser - dynamisk bibliotek for jellyfish

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

Download quorum

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	114.5 kB	400.0 kB	[list of files]