Package: iqtree (2.0.7+dfsg-1 and others)

[ Source: iqtree  ]

Effektivt fylogenetisk program ved maksimal sandsynlighed

IQ-TREE er et meget effektivt maksimal sandsynlighedsfylogenetisk program med følgende nøglefunktioner blandt flere:

 * En hidtil ukendt hurtig og effektiv stokastisk algoritme til at
   estimere maksimale sandsynlighedstræer. IQ-TREE overgår både RAxML
   og PhyML i form af sandsynlighed, men kræver tilsvarende mængde
   beregning (se Nguyen et al., 2015)
 * En ultrahurtig bootstrap-tilnærmelse til at vurdere branchestøtter
   (se Minh et al., 2013)
 * En bred vifte af substitutionsmodeller for binær, DNA, protein, codon,
   og morfologiske tilpasninger
 * Ultrahurtig model valg for alle datatyper, 10 til 100 gange hurtigere
   end jModelTest og ProtTest
 * Find bedste partitionsskema ligesom PartitionFinder
 * Partitioneret modeller med blandede datatyper for fylogenetiske
   (multigenfamilier) sammenligninger, der giver mulighed for separate,
   proportionale, eller fælles grenlængder blandt gener
 * Støtte til fylogenetisk sandsynlighedsbibliotek (PLL) (se Flouri et
   al., 2014)

Other Packages Related to iqtree

• dep: libc6 (>= 2.38)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 4.0)

  GCC støttebibliotek

• dep: libgomp1 (>= 6)

  GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)

• dep: libopenmpi40 (>= 5.0.6)

  Bibliotek til beskedvideresendelse med høj ydelse - delt bibliotek

• dep: libstdc++6 (>= 14)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

Download iqtree

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	2.0.7+dfsg-1+b2	3,566.8 kB	25,632.0 kB	[list of files]