Package: gromacs (2024.4-1)

[ Source: gromacs  ]

Simulator af molekyldynamik med bygge- og analyseværktøjer

GROMACS er en alsidig pakke til at udføre molekyldynamik med, dvs. simulere Newtons bevægelsesligninger for systemer med hundrede til millioner partikler.

GROMACS er primært designet til biokemiske molekyler såsom proteiner og lipider, som har en masse komplicerede bindingsvekselvirkninger, men da GROMACS er ekstremt hurtig til at beregne ikke-bindingsvekselvirkninger (som plejer at dominere simuleringer), anvender mange grupper det også til forskning inden for ikke-biologiske systemer, f.eks. polymerer.

Denne pakke indeholder varianter både for afvikling på en enkelt maskine og via MPI-grænsefladen på tværs af flere maskiner.

Tags: Field: Biology, Structural Biology, field::chemistry, implemented-in::c, User Interface: Command Line, interface::graphical, interface::x11, Role: Program, Interface Toolkit: X library, X Window System: Application

Other Packages Related to gromacs

• dep: gromacs-data (= 2024.4-1)

  GROMACS simulator for molekyldynamik - data og dokumentation

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  GCC støttebibliotek

• dep: libgromacs9 (>= 2024.4)

  GROMACS-molekylære dynamiske simulator - delte biblioteker

• dep: libopenmpi3t64 (>= 5.0.5)

  Bibliotek til beskedvideresendelse med høj ydelse - delt bibliotek

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: sse4.2-support

  CPU-funktionskontrol - require SSE4.2

• rec: cpp

  GNU C-præprocessor (cpp)

• rec: mpi-default-bin

  MPI-kørselstidsprogrammer - metapakke

• sug: pymol

  System til molekylærgrafik

Download gromacs

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	62.5 kB	453.0 kB	[list of files]