Package: flye (2.9.5+dfsg-1)

[ Source: flye  ]

De novo-samler for enkeltt molekylær sekventeringslæsninger via repeat-grafer

Flye er en de novo-samler for enkelte molekylære sekventeringslæsninger, såsom dem fremstillet af PacBio og Oxford Nanopore Technologies. Det er designet for en bred vifte af datasæt, fra små bakterieprojekter til store samlinger for pattedyr. Pakken repræsenterer en fuldstændig datakanal: Den bruger rå PacBio/ONT-læsninger som inddata og fremstiller polerede contig'er. Flye har også en speciel tilstand for metagenomsamling.

Other Packages Related to flye

• dep: libc6 (>= 2.38)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  GCC støttebibliotek

• dep: libstdc++6 (>= 14)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: minimap2

  Alsidig parvis sammenligner for genomiske og opdelte nukleotide sekvenser

• dep: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

• dep: python3-six

  Python 2- og 3-kompatibilitetsbibliotek

• dep: samtools

  Forarbejdning af sekvensopstillinger i SAM-, BAM- og CRAM-formater

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

Download flye

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	22,656.8 kB	36,930.0 kB	[list of files]