Package: density-fitness (1.0.12-2)

[ Source: density-fitness  ]

Beregner pr. rest elektrontæthedsbedømmelser

Programmet density-fitness beregner elektrontæthedsmålinger, for main- (inkluderer Cβ atom) og side-chain atomer med individuelle rester.

For denne beregning bruger programmet strukturmodellen i enten PDB- eller mmCIF-format og elektrontætheden fra kortene 2mFo-DFc og mFo-DFc. Hvis disse kort ikke er let tilgængelige kan MTZ-filen og -modellen bruges til at beregne kortklipper. Density-fitness understøtter både røntgen- og elektrondiffraktionsdata.

Dette program er grundlæggende en ny implementering af edstats, et program tilgængelig fra CCP4-programpakken. Resultatet består dog kun af RSR-, SRSR- og RSCC-felterne som i edstats med tilføjelse af EDIAm og OPIA og kræver ikke længere at kortkoefficienter er forhåndsberegnede.

Other Packages Related to density-fitness

• dep: libc6 (>= 2.38)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libcifpp7 (>= 7.0.7)

  Biblioteksfiler for libcifpp

• dep: libclipper2 (>= 2.1.20201109)

  object oriented library for crystallographic computing

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  GCC støttebibliotek

• dep: libpdb-redo3 (>= 3.1.5)

  Biblioteksfil for lipdb-redo

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: libzeep5.1 (>= 5.1.8)

  Library file for libzeep

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

Download density-fitness

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	482.4 kB	5,862.0 kB	[list of files]