Package: biosquid (1.9g+cvs20050121-15.1 and others)

[ Source: biosquid  ]

Redskaber for biologisk sekvensanalyse

SQUID er et bibliotek af C-kodefunktioner for sekvensanalyse. Programmet inkluderer også en antal små redskabsprogrammer til at konvertere, vise statistik, manipulere og udføre andre funktioner på sekvensfiler.

Det oprindelige navn på pakken er »squid«, men da der allerede er en squid i arkivet (en proxy-cache), blev den omdøbt til »biosquid«.

Denne pakke indeholder nogle værktøjer til at demonstrere funktionerne i SQUID-biblioteket.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, use::converting, Editing, Supports Format: works-with-format::TODO, works-with::TODO

Other Packages Related to biosquid

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libsquid1t64 (= 1.9g+cvs20050121-15.1+b1)

  biosquid dynamic library for biological sequence analysis

• rec: hmmer

  Profilskjulte Markov-modeller for proteinsekvensanalyse

Download biosquid

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	1.9g+cvs20050121-15.1+b1	77.8 kB	366.0 kB	[list of files]