Package: r-bioc-deseq2 (1.44.0+dfsg-1) [debports]

[ Source:  ]

R-pakke for RNS-Seq-differentiel udtryksanalyse

Differentiel genekspressionsanalyse baseret på den negative binomiale fordeling. Skønnet varians-middelafhængighed i antalsdata fra sekvenseringsanalyser med høj kapacitet og test for differentiel udtryk baseret på en model, der bruger den negative binomiale fordeling.

Other Packages Related to r-bioc-deseq2

• dep: libblas3

  Grundlæggende reference-implementeringer til lineær algebra, delt bibliotek

  or libblas.so.3

  virtual package provided by libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6.1 (>= 2.29)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  GCC støttebibliotek

• dep: liblapack3

  Bibliotek for lineære algebrarutiner 3 - delt version

  or liblapack.so.3

  virtual package provided by libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libstdc++6 (>= 14)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: r-api-4.0

  virtual package provided by r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.19

  virtual package provided by r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-biobase (>= 2.64.0)

  Grundlæggende funktioner for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.50.0)

  Generiske funktioner for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocparallel (>= 1.38.0)

  BioConductor - faciliteter for parallel evulering

• dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.56.1)

  BioConductor-repræsentation og manipulation af genomiske intervaller

• dep: r-bioc-iranges (>= 2.38.1)

  GNU R - containere på lavt niveau til at lagre sæt af heltalsintervaller

• dep: r-bioc-matrixgenerics (>= 1.16.0)

  S4-genriske summeringsstatistikfunktioner der fungerer på matrix-lignende objekter

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.42.1)

  BioConductor S4-implementering af vektorer og lister

• dep: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.34.0)

  BioConductor - assay-container

• dep: r-cran-ggplot2 (>= 3.4.0)

  Implementering af Grammar of Graphics

• dep: r-cran-locfit

  GNU R local regression, likelihood and density estimation

• dep: r-cran-matrixstats

  GNU R methods that apply to rows and columns of a matrix

• dep: r-cran-rcpp (>= 0.11.0)

  GNU R-pakke for Seamless R og C++-integration

• dep: r-cran-rcpparmadillo

  GNU R-pakke for det Armadillo C++-lineære algebrabibliotek

• sug: r-bioc-glmgampoi (>= 1.16.0)

  GNU R - tilpas en Gamma-Poisson generaliseret lineær model

• sug: r-bioc-tximeta (>= 1.22.1)

  Transcript Quantification Import with Automatic Metadata

• sug: r-bioc-tximport (>= 1.32.0)

  Estimater på transkriptniveau for biologisk sekventering

• sug: r-bioc-tximportdata (>= 1.32.0)

  GNU R various transcript abundance quantifiers

• sug: r-cran-biocmanager

  Tilgå pakkearkivet for Bioconductorprojektet

• sug: r-cran-knitr

  GNU R-pakke for dynamisk rapportoprettelse via Literate Programming

• sug: r-cran-pbapply

  GNU R-pakker der tilbyder statusbjælker for vektoriserede R-funktioner

• sug: r-cran-pheatmap

  GNU R-pakke til at oprette smukke varmekort

• sug: r-cran-rcolorbrewer

  GNU R-pakke der tilbyder egnede farvepaletter

• sug: r-cran-readr

  GNU R package to read rectangular text data

• sug: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

• sug: r-cran-testthat

  GNU R-testpakke

Download r-bioc-deseq2

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	1,245.5 kB	1,752.0 kB	[list of files]