Package: kissplice (2.2.1-1) [debports]

[ Source:  ]

Detektion af diverse slags polymorfismer i RNA-sekvensdata

KisSplice er et program, som gør det muligt at analysere RNA-sekvensdata med eller uden en referencearvemasse. Det er en præcis lokal transcriptome assembler hvor du kan identificere SNP'er, indels og alternative splicing-hændelser. Programmet kan håndtere et arbitrært antal biologiske betingelser og vil kvantificere hver variant i hver betingelse. Programmet er blevet testet på Illumina-datasæt på op til 1G-læsninger. Dets hukommelsesforbrug er omkring 5 Gb for 100 millioner læsninger.

Other Packages Related to kissplice

• dep: libc6.1 (>= 2.4)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:4.1.1)

  Package not available

• dep: libstdc++6 (>= 4.9)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: python

  Package not available

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

Download kissplice

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	596.7 kB	1,376.0 kB	[list of files]