Package: r-bioc-phyloseq (1.50.0+dfsg-1)

[ Source: r-bioc-phyloseq  ]

Experimental package

Warning: This package is from the experimental distribution. That means it is likely unstable or buggy, and it may even cause data loss. Please be sure to consult the changelog and other possible documentation before using it.

GNU R-håndtering og analyse af høj-gennemløb microbiome censusdata

Bioconductor-modulet phyloseq tilbyder et sæt af klasser og værktøjer til at facilitere import, lager, analyse og grafisk visning af microbiome censusdata.

Other Packages Related to r-bioc-phyloseq

• dep: r-api-4.0

  Package not available

• dep: r-api-bioc-3.20

  Package not available

• dep: r-bioc-biobase (>= 2.36.2)

  Grundlæggende funktioner for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.22.0)

  Generiske funktioner for Bioconductor

• dep: r-bioc-biomformat (>= 1.0.0)

  GNU R-grænsefladepakke for filformatet BIOM

• dep: r-bioc-biostrings (>= 2.40.0)

  GNU R-strengobjekter der repræsenterer biologiske sekvenser

• dep: r-bioc-multtest (>= 2.28.0)

  Biocunductor resampling-baseret flerhypotesetest

• dep: r-cran-ade4 (>= 1.7-4)

  GNU R-analyse af økologiske data

• dep: r-cran-ape (>= 5.0)

  GNU R-pakke for Analyses of Phylogenetics and Evolution

• dep: r-cran-cluster (>= 2.0.4)

  GNU R-pakke for klyngeanalyse af Rousseeuw et al

• dep: r-cran-data.table (>= 1.10.4)

  GNU R-udvidelse af Data.frame

• dep: r-cran-foreach (>= 1.4.3)

  GNU R - looping-understøttelse for foreach

• dep: r-cran-ggplot2 (>= 2.1.0)

  Implementering af Grammar of Graphics

• dep: r-cran-igraph (>= 1.0.1)

  GNU R-netværksanalyse og visualisering

• dep: r-cran-plyr (>= 1.8.3)

  tools for splitting, applying and combining data

• dep: r-cran-reshape2 (>= 1.4.1)

  Fleksibelt omdanne data - en genstart af pakken reshape

• dep: r-cran-scales (>= 0.4.0)

  Skaler funktioner for visualisering

• dep: r-cran-vegan (>= 2.5)

  Fællesskabsøkologi for R

• sug: r-bioc-biocstyle (>= 2.4)

  Standardstile for vignettes og andre Biocunductor-dokumenter

• sug: r-bioc-deseq2 (>= 1.16.1)

  R-pakke for RNS-Seq-differentiel udtryksanalyse

• sug: r-bioc-genefilter (>= 1.58)

  Metoder for filtrering af gener fra microarray-eksperimenter

• sug: r-bioc-metagenomeseq (>= 1.14)

  GNU R-statistisk analyse for tynd høj-gennemløb sekventering

• sug: r-cran-knitr (>= 1.16)

  GNU R-pakke for dynamisk rapportoprettelse via Literate Programming

• sug: r-cran-magrittr (>= 1.5)

  GNU R - operatør for fremadrettet datakanal

• sug: r-cran-rmarkdown (>= 1.6)

  convert R markdown documents into a variety of formats

• sug: r-cran-testthat (>= 1.0.2)

  GNU R-testpakke

Download r-bioc-phyloseq

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	2,204.1 kB	3,134.0 kB	[list of files]