Package: r-bioc-shortread (1.64.0-1)

[ Source: r-bioc-shortread  ]

Experimental package

Warning: This package is from the experimental distribution. That means it is likely unstable or buggy, and it may even cause data loss. Please be sure to consult the changelog and other possible documentation before using it.

GNU R - klasser og metoder for høj-gennemløb kort-læsning sekventeringsdata

Dette BioConductor-modul er en pakke for inddata, kvalitetsvurdering, manipulering og uddata for høj-gennemløb sekventeringsdata. ShortRead tilbydes i R- og BioConductor-miljøerne, hvilket giver klar adgang til yderligere faciliteter for avanceret statistisk analyse, datatransformation, visualisering og integration med diverse genomressourcer.

Other Packages Related to r-bioc-shortread

• dep: libc6 (>= 2.27)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  GCC støttebibliotek

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: r-api-4.0

  Package not available

• dep: r-api-bioc-3.20

  virtual package provided by r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-biobase

  Grundlæggende funktioner for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.23.3)

  Generiske funktioner for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocparallel

  BioConductor - faciliteter for parallel evulering

• dep: r-bioc-biostrings (>= 2.47.6)

  GNU R-strengobjekter der repræsenterer biologiske sekvenser

• dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.15.2)

  BioConductor-redskaber til at manipulere kromosomidentifikatorer

• dep: r-bioc-genomicalignments (>= 1.15.6)

  Bioconductor-repræsentation og manipulering af korte arvemassesammenligninger

• dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.31.8)

  BioConductor-repræsentation og manipulation af genomiske intervaller

• dep: r-bioc-iranges (>= 2.13.12)

  GNU R - containere på lavt niveau til at lagre sæt af heltalsintervaller

• dep: r-bioc-pwalign

  Perform pairwise sequence alignments

• dep: r-bioc-rhtslib

  HTSlib high-throughput sequencing library as GNU R package

• dep: r-bioc-rsamtools (>= 1.31.2)

  GNU R-binær sammenligning (BAM), variantkald (BCF) eller tabix-filimport

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.17.25)

  BioConductor S4-implementering af vektorer og lister

• dep: r-bioc-xvector

  BioConductor-repræsentation og manipulering af eksterne sekvenser

• dep: r-cran-hwriter

  HTML Writer - R-objekter i HTML-format

• dep: r-cran-lattice

  GNU R-pakke for »Trellis«-grafik

• dep: r-cran-latticeextra

  GNU R-pakke for yderligere grafiske visninger baseret på lattice

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

• sug: r-bioc-biocstyle

  Standardstile for vignettes og andre Biocunductor-dokumenter

• sug: r-bioc-biomart

  GNU R Interface til BioMart-databsaer (Ensembl, COSMIC, Wormbase og Gramene)

• sug: r-bioc-genomicfeatures

  GNU R-værktøjer til at lave og manipulere transcript centric-annotationer

• sug: r-cran-knitr

  GNU R-pakke for dynamisk rapportoprettelse via Literate Programming

• sug: r-cran-runit

  GNU R-pakke der tilbyder en ramme for enhedstest

Download r-bioc-shortread

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
riscv64	5,092.7 kB	8,186.0 kB	[list of files]