Package: r-bioc-structuralvariantannotation (1.22.0+ds-1)

[ Source: r-bioc-structuralvariantannotation  ]

Experimental package

Warning: This package is from the experimental distribution. That means it is likely unstable or buggy, and it may even cause data loss. Please be sure to consult the changelog and other possible documentation before using it.

Variantannotationer for strukturelle varianter

StructuralVariantAnnotation indeholder nyttige hjælpefunktioner for håndtering af strukturelle varianter i VCF-format. Pakkerne indeholder funktioner til at fortolke VCF'er fra et antal populære kaldere samt funktioner til at håndtere stoppunkter involverende to separate genomiske loci kodet som GRange-objekter.

Other Packages Related to r-bioc-structuralvariantannotation

• dep: r-api-4.0

  Package not available

• dep: r-api-bioc-3.20

  virtual package provided by r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-biocgenerics

  Generiske funktioner for Bioconductor

• dep: r-bioc-biostrings

  GNU R-strengobjekter der repræsenterer biologiske sekvenser

• dep: r-bioc-genomeinfodb

  BioConductor-redskaber til at manipulere kromosomidentifikatorer

• dep: r-bioc-genomicfeatures

  GNU R-værktøjer til at lave og manipulere transcript centric-annotationer

• dep: r-bioc-genomicranges

  BioConductor-repræsentation og manipulation af genomiske intervaller

• dep: r-bioc-iranges

  GNU R - containere på lavt niveau til at lagre sæt af heltalsintervaller

• dep: r-bioc-pwalign

  Perform pairwise sequence alignments

• dep: r-bioc-rtracklayer

  GNU R-grænseflade til genombrowsere og deres annotationsspor

• dep: r-bioc-s4vectors

  BioConductor S4-implementering af vektorer og lister

• dep: r-bioc-summarizedexperiment

  BioConductor - assay-container

• dep: r-bioc-variantannotation

  BioConductor-annotation af genetiske varianter

• dep: r-cran-assertthat

  GNU R easy pre and post assertions

• dep: r-cran-dplyr

  GNU R-grammatik for datamanipulering

• dep: r-cran-rlang

  Funktioner for basistyper samt Core R- og »Tidyverse«-funktioner

• dep: r-cran-stringr

  Gør det nemmere at arbejde med strenge

• sug: r-bioc-biovizbase

  GNU R-grundlæggende grafiske redskaber for visualsiering af genomiske data

• sug: r-bioc-ggbio

  Visualization tools for genomic data

• sug: r-cran-devtools

  Værktøjer til at gøre udvikling af R-pakker hurtigere

• sug: r-cran-ggplot2

  Implementering af Grammar of Graphics

• sug: r-cran-knitr

  GNU R-pakke for dynamisk rapportoprettelse via Literate Programming

• sug: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

• sug: r-cran-roxygen2

  in-line documentation for GNU R

• sug: r-cran-testthat (>= 2.1.0)

  GNU R-testpakke

• sug: r-cran-tidyverse

  Easily Install and Load the 'Tidyverse'

Download r-bioc-structuralvariantannotation

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	391.6 kB	1,297.0 kB	[list of files]