Package: libhts-dev (1.21+ds-0+exp2) [debports]

[ Source:  ]

Experimental package

Warning: This package is from the experimental distribution. That means it is likely unstable or buggy, and it may even cause data loss. Please be sure to consult the changelog and other possible documentation before using it.

Udviklingsfiler for HTSlib

HTSlib er en implementering af et ensartet C-bibliotek for adgang til fælles filformater, såsom SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM og VCF (Variant Call Format), brugt for sekvensdata med høj gennemløb, og er basisbiblioteket brugt af samtools og bcftools. HTSlib afhænger kun af zlib. Det vides at være kompatibelt med gcc, g++ og clang.

HTSlib implementerer et generaliseret BAM-indeks (binær SAM), med filudvidelsen »csi« (coordinate-sorted index). HTSlib-fillæseren kigger først efter nye indeks og så efter gamle hvis et nyt indeks mangler.

Denne pakke indeholder udviklingsfiler for HTSlib: teksthoveder, statisk bibliotek, manualsider etc.

For kompatibilitet med sambamba blev den interne rutine, cram_to_bam, eksporteret. Hermed adopteres en rettelse fundet i guix.

Other Packages Related to libhts-dev

• dep: libbz2-dev

  højkvalitets blok-sorterende filkomprimeringsbibliotek - udvikling

• dep: libcurl4-gnutls-dev

  Udviklingsfiler og dokumentation for libcurl - GnuTLS-variant

• dep: libdeflate-dev

  Teksthovedbibliotek for fuld buffer kompression og dekompression

• dep: libhts3t64 (= 1.21+ds-0+exp2)

  C-bibliotek for høj-gennemløb sekvensdataformater

• dep: liblzma-dev

  Kompressionsbibliotek for XZ-formatet - udviklingsfiler

• dep: zlib1g-dev

  Komprimeringsbibliotek - udvikling

Download libhts-dev

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	1,694.6 kB	7,652.0 kB	[list of files]