Package: sumaclust (1.0.31-2)

[ Source: sumaclust  ]

Hurtig og præcis klyngeopsætning af genomsekvenser

Med udviklingen af den næste generation af sekventering skal effektive værktøjer håndterer millioner af sekvenser på en fornuftig tid. Sumaclust er et program udviklet af LECA. Sumaclust forsøger at klyngeopsætte sekvenser på en måde som er hurtig og præcis på samme tid. Dette værktøj er blevet udviklet som en tilpasning til den type af data som oprettes af DNA-metastregkodere, dvs. fuldt ud sekventeret, korte markører. Sumaclust klyngeopsætter via de samme klyngealgoritmer som UCLUST og CD-HIT. Denne algoritme er hovedsagelig nyttig til at registrere de »fejlramte« sekvenser opretter under amplifikation og sekvensprotokoller, afledt fra »true« sekvenser.

Other Packages Related to sumaclust

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.7) [armhf, i386]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)

Download sumaclust

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	110.5 kB	189.0 kB	[list of files]
arm64	111.6 kB	188.0 kB	[list of files]
armhf	110.1 kB	164.0 kB	[list of files]
i386	117.1 kB	200.0 kB	[list of files]