Package: r-bioc-annotationhub (2.14.3+dfsg-1)

[ Source: r-bioc-annotationhub  ]

GNU R-klient til at tilgå AnnotationHub-ressourcer

Denne pakke tilbyder en klient for Bioconductor AnnotationHub- internetressourcen. AnnotationHub-internetressourcen tilbyder en central lokation hvor genomiske filer (f.eks., VCF, bed, wig) og andre ressourcer fra standardlokationer (f.eks. UCSC, Ensembl) kan registreres. Ressourcen inkluderer metadata om hver ressource, f.eks., en tekstbeskrivelse, mærker og ændringsdato. Klienten opretter og håndtere et lokalt mellemlager med filer hentet af brugeren, hjælper med hurtig og reproducerbar adgang.

Other Packages Related to r-bioc-annotationhub

• dep: r-api-3.5

  virtual package provided by r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.8

  virtual package provided by r-bioc-biocgenerics

• dep: r-base-core (>= 3.5.2-1)

  GNU R-kerne af statistisk beregning og grafiksystem

• dep: r-bioc-annotationdbi (>= 1.31.19)

  GNU R Annotation Database-grænseflade for BioConductor

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.15.10)

  Generiske funktioner for Bioconductor

• dep: r-bioc-interactivedisplaybase

  Basispakke for aktivering af funktionsrige skinnende netvisninger af Bioconductor-objekter

• dep: r-bioc-s4vectors

  BioConductor S4-implementering af vektorer og lister

• dep: r-cran-biocmanager

  Tilgå pakke arkivet for Bioconductorprojektet

• dep: r-cran-curl

  GNU R modern and flexible web client for R

• dep: r-cran-httr

  GNU R-værktøjer for arbejdet med adresser og HTTP

• dep: r-cran-rsqlite

  Database Interface R-driver for SQLite

• dep: r-cran-yaml

  Methods to convert R data to YAML and back

• rec: r-bioc-genomicranges

  BioConductor-repræsentation og manipulation af genomiske intervaller

• rec: r-cran-runit

  GNU R-pakke der tilbyder en ramme for enhedstest

• sug: r-bioc-biostrings

  GNU R-strengobjekter der repræsenterer biologiske sekvenser

• sug: r-bioc-genomeinfodb

  BioConductor-redskaber til at manipulere kromosomidentifikatorer

• sug: r-bioc-genomicfeatures

  GNU R-værktøjer til at lave og manipulere transcript centric-annotationer

• sug: r-bioc-iranges

  GNU R - containere på lavt niveau til at lagre sæt af heltalsintervaller

• sug: r-bioc-rsamtools

  GNU R-binær sammenligning (BAM), variantkald (BCF) eller tabix-filimport

• sug: r-bioc-rtracklayer

  GNU R-grænseflade til genombrowsere og deres annotationsspor

• sug: r-bioc-summarizedexperiment

  BioConductor - assay-container

• sug: r-bioc-variantannotation

  BioConductor-annotation af genetiske varianter

• sug: r-cran-knitr

  GNU R-pakke for dynamisk rapportoprettelse via Literate Programming

Download r-bioc-annotationhub

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	339.0 kB	579.0 kB	[list of files]