Package: chromhmm-example (1.18+dfsg-1)
Links for chromhmm-example
Debian Resources:
Download Source Package chromhmm:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [compbio.mit.edu]
Similar packages:
Kromatintilstandsregistrering og karakterisering - eksempel
ChromHMM er et program til at lære og karakterisere kromatintilstande. ChromHMM kan integrere flere kromatindatasæt såsom ChIP-seq-data af diverse histone ændringer for at registrere de novo the major gentagende kombinatoriske og delvise mærkemønstre. ChromHMM er baseret på en multivariat Hidden Markov-model, som eksplicit modelopbygger tilstedeværelsen eller fraværet af hvert kromatinmærke. Resultatmodellen kan så bruges til systematisk at annotere et genom i en eller flere celletyper. Ved automatisk at beregne tilstandsforbedringer for funktionelle og annoterede datasæt i stor skala letter ChromHMM den biologiske karakterisering af hver tilstand. ChromHMM fremstiller også filer med genomomfattede kort af kromatintilstandsannotationer, som direkte kan visualiseres i en genombrowser.
Denne pakke tilbyder et eksempel til arbejdet med ChromHMM.
Other Packages Related to chromhmm-example
|
|
|
|
-
- enh: chromhmm
- Kromatintilstandsregistrering og karakterisering
Download chromhmm-example
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| all | 37,157.6 kB | 37,362.0 kB | [list of files] |