Package: r-bioc-deseq2 (1.22.2+dfsg-1)

[ Source: r-bioc-deseq2  ]

R-pakke for RNS-Seq-differentiel udtryksanalyse

Differentiel genekspressionsanalyse baseret på den negative binomiale fordeling. Skønnet varians-middelafhængighed i antalsdata fra sekvenseringsanalyser med høj kapacitet og test for differentiel udtryk baseret på en model, der bruger den negative binomiale fordeling.

Other Packages Related to r-bioc-deseq2

• dep: libblas3

  Grundlæggende reference-implementeringer til lineær algebra, delt bibliotek

  or libblas.so.3

  virtual package provided by libatlas3-base, libblas3, libblis2-openmp, libblis2-pthread, libblis2-serial, libopenblas-base

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armhf, i386]

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [not armhf]

  GCC støttebibliotek

  dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]

• dep: libgfortran5 (>= 8)

  Kørselstidsbibliotek for GNU Fortran-programmer

• dep: liblapack3

  Bibliotek for lineære algebrarutiner 3 - delt version

  or liblapack.so.3

  virtual package provided by libatlas3-base, liblapack3, libopenblas-base

• dep: libquadmath0 (>= 4.6) [amd64, i386]

  GCC-bibliotek med firdobbelt præcision for matematik

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: r-api-3.5

  virtual package provided by r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.8

  virtual package provided by r-bioc-biocgenerics

• dep: r-base-core (>= 3.5.2-1)

  GNU R-kerne af statistisk beregning og grafiksystem

• dep: r-bioc-biobase

  Grundlæggende funktioner for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.7.5)

  Generiske funktioner for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocparallel

  BioConductor - faciliteter for parallel evulering

• dep: r-bioc-genefilter

  Metoder for filtrering af gener fra microarray-eksperimenter

• dep: r-bioc-geneplotter

  R-pakke med funktioner til plot af genomdata

• dep: r-bioc-genomicranges

  BioConductor-repræsentation og manipulation af genomiske intervaller

• dep: r-bioc-iranges

  GNU R - containere på lavt niveau til at lagre sæt af heltalsintervaller

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.9.25)

  BioConductor S4-implementering af vektorer og lister

• dep: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.1.6)

  BioConductor - assay-container

• dep: r-cran-ggplot2

  Implementering af Grammar of Graphics

• dep: r-cran-hmisc

  GNU R - diverse funktioner af Frank Harrell

• dep: r-cran-rcpp (>= 0.11.0)

  GNU R-pakke for Seamless R og C++-integration

• sug: r-cran-knitr

  GNU R-pakke for dynamisk rapportoprettelse via Literate Programming

• sug: r-cran-pbapply

  GNU R-pakker der tilbyder statusbjælker for vektoriserede R-funktioner

• sug: r-cran-pheatmap

  GNU R-pakke til at oprette smukke varmekort

• sug: r-cran-rcolorbrewer

  GNU R-pakke der tilbyder egnede farvepaletter

• sug: r-cran-readr

  GNU R package to read rectangular text data

• sug: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

• sug: r-cran-testthat

  GNU R-testpakke

Download r-bioc-deseq2

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	1,180.2 kB	1,711.0 kB	[list of files]
arm64	1,170.6 kB	1,679.0 kB	[list of files]
armhf	1,170.0 kB	1,625.0 kB	[list of files]
i386	1,184.1 kB	1,700.0 kB	[list of files]