Package: trace2dbest (3.0.1-1)

[ Source: trace2dbest  ]

Saml indsendelse af chromatogramdata til dbEST

EST'er er korte sekvenser afledt fra omvendt-transkriberet RNA. Deres overflod giver indsigt i udtrykket af gener på tværs af væv, understøtter registrering af nye gener og gør det muligt at tilgå dækningen af hele genomsekvensprojekter. Offentlige databaser såsom dbEST hos NCBI indsamler disse data.

Trace2dbEST behandler rå sekventerede chromatograf-tracefiler fra eST-projekter til kvalitetskontrollerede sekvenser, klar til indsendelse til dbEST. Trace2dbEST vejleder dig igennem oprettelsen af alle de nødvendige filer for indsendelse af EST'er til dbEST. Trace2dbest gør brug af andre programmer (tilgængelige frit under akademisk licens), som du skal have installeret, navnlig phred, cross_match og (valgfrit) BLAST.

Other Packages Related to trace2dbest

• dep: perl

  Larry Walls praktiske uddragnings- og rapportsprog (Perl)

Download trace2dbest

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	28.7 kB	132.0 kB	[list of files]