Package: assemblytics (1.0+ds-1)

[ Source: assemblytics  ]

Registrer og analyser strukturelle varianter fra en genomsamling

Assemblytics indarbejder en unik ankerfiltreringsfremgangsmåde til at øge robusthed for gentagende elementer og identificerer seks klasse af varianter baseret på deres unikke sammenligningssignaturer. Assemblytics kan anvendes både til at sammenligne afvigende genomer, såsom kræft i mennesker, til en reference, eller til at identificere forskelle mellem forbundne arter.

Other Packages Related to assemblytics

• dep: perl

  Larry Walls praktiske uddragnings- og rapportsprog (Perl)

• dep: python

  Interaktivt objektorienteret sprog på højt niveau - Python 2-version

• dep: python-numpy

  Numerisk Python tilføjer en hurtig vektor-/array-facilitet til Pythonsproget

• dep: r-base-core

  GNU R-kerne af statistisk beregning og grafiksystem

• dep: r-cran-ggplot2

  Implementering af Grammar of Graphics

• dep: r-cran-plyr

  tools for splitting, applying and combining data

• dep: r-cran-rcolorbrewer

  GNU R-pakke der tilbyder egnede farvepaletter

• rec: mummer

  Effektiv sekvensjustering for hele genomer

Download assemblytics

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	18.4 kB	88.0 kB	[list of files]