Package: plink1.9 (1.90~b6.6-181012-1)

[ Source: plink1.9  ]

Værktøjssæt til associationsanalyse for hele genomer

Plink forventer data fra SNP-chip (single nucleotide polymorphism) for mange individuelle og deres fænotypiske beskrivelse af en sygdom. Programmet finder associationer for enkelte eller par af DNA-variationer med en fænotype og kan hente SNP-annotation fra en netkilde.

SNP'er kan evalueres individuelt eller som par for deres association med sygdomsfænotyper. Den samlede undersøgelse af kopiantalvariationer er understøttet. En række statistiske test er blevet implementeret.

Plink1.9 er en omfattende opdatering af plink med nye algoritmer og nye metoder, hurtigere og mindre hukommelsesforbrugende end den første plink.

Bemærk venligst: Den kørbare fil blev omdøbt til plink1.9 på grund af et navnesammenfald. Læs venligst mere om dette i /usr/share/doc/plink1.9/README.Debian.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Purpose: Analysing

Other Packages Related to plink1.9

• dep: libatlas3-base

  Automatisk Tunet Lineær Algebra Software, generisk delt

• dep: libblas3

  Grundlæggende reference-implementeringer til lineær algebra, delt bibliotek

  or libblas.so.3

  virtual package provided by libatlas3-base, libblas3, libblis2-openmp, libblis2-pthread, libblis2-serial, libopenblas-base

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.27) [not amd64]

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [amd64]

  GCC støttebibliotek

  dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]

  dep: libgcc1 (>= 1:4.2) [i386]

• dep: liblapack3

  Bibliotek for lineære algebrarutiner 3 - delt version

  or liblapack.so.3

  virtual package provided by libatlas3-base, liblapack3, libopenblas-base

• dep: libstdc++6 (>= 5)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

Download plink1.9

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	858.7 kB	2,109.0 kB	[list of files]
armhf	767.7 kB	1,428.0 kB	[list of files]
i386	862.5 kB	2,352.0 kB	[list of files]