Package: minimac4 (1.0.0-2)

[ Source: minimac4  ]

Fast Imputation baseret på State Space Reduction HMM

Minimac4 er en implementering af »minimac2/3« med lavere hukommelsesforbrug og bedre beregningsmæssig effektivitet. Det er en algoritme for genotypisk imputation, der fungerer på fasede genotyper (som f.eks. MacH).

Minimac4 er designet til at håndtere meget store referencepaneler på en mere effektiv måde uden tab af præcision. Denne algoritme analyserer kun de unikke sæt af haplotyper i små genomiske segmenter, og sparer derfor på tid/-kompleksitet, beregningsmæssig hukommelse, men har intet tab i præcisionsgraden.

Other Packages Related to minimac4

• dep: libc6 (>= 2.14)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

  GCC støttebibliotek

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)

• dep: libstatgen0 (>= 1.0.14)

  Behandling og analyse af næste generations sekventerings- og genfastlæggelsesdata - bibliotek

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

Download minimac4

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	1,742.8 kB	2,157.0 kB	[list of files]