Package: libseqlib-dev (1.1.2+dfsg-3)

[ Source: libseqlib  ]

C++ htslib/bwa-mem/fermi-grænseflade for interrogating sequence-data - udv.

C++-API og kommandolinjeværktøj der tilbyder en hurtig og brugervenlig grænseflade til BAM/SAM/CRAM-filer, globale sekvenssammenligningsoperationer og sekvenssamling. Fire C-biblioteker udfører de grundlæggende operationer i SeqLib: HTSlib for BAM-adgang, BWA-MEM og BLAT for sekvenssammenligning og Fermi for fejlrettelse og sekvenssamling. Sammenligninger indikerer at SeqLib har lavere cpu- og hukommelseskrav end førende C++-sekvensanalyse-API'er. Minimal SeqLib-kode kan udtrække, rette fejl og samle læsninger fra en CRAM-fil og så sammenligne med BWA-MEM. SeqLib tilyder også yderligere funktioner, inklusive kromosom-egnede intervalforespørgsler og plot med læsninger. Kommandolinjeværktøjer er tilgængelige for udførelse af integreret fejlrettelse, mikrosamlinger og sammenligning.

Denne pakke indeholder teksthovedfilerne og det statiske bibliotek.

Tags: Software Development: Libraries, Role: Development Library

Other Packages Related to libseqlib-dev

• dep: libbwa-dev

  Burrows-Wheeler Aligner - kildefiler

• dep: libfml-dev

  Udviklingsteksthoveder for libfml

• dep: libhts-dev (>= 1.3.2-3)

  Udviklingsfiler for HTSlib

• dep: libhts-private-dev

  private development files for the HTSlib (use with care)

• dep: libjsoncpp-dev

  library for reading and writing JSON for C++ (devel files)

• dep: libseqlib1 (= 1.1.2+dfsg-3)

  C++ htslib/bwa-mem/fermi-grænseflade for interrogating sequence-data

Download libseqlib-dev

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	161.5 kB	933.0 kB	[list of files]