Package: snpomatic (1.0-4)

[ Source: snpomatic  ]

Hurtig, stringent kort-læsning oversættelsesprogram

Sekvensteknologier med høj gennemløb opretter store mængder af korte læsninger. Oversættelse af disse til en referencesekvens forbruger store mængder af behandlingstid og hukommelse, og læste oversættelsesfejl kan føre til støj eller ukorrekte sammenligninger.

SNP-o-matic er et hurtigt, stringent kort-læsning oversættelsesprogram. Det understøtter en mængde af uddatatyper og formater, for brug i filtrering, sammenligninger, sekvensbaseret genotypekald, assisteret nysamling af contigs etc.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, works-with::biological-sequence

Other Packages Related to snpomatic

• dep: libc6 (>= 2.4)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

  GCC støttebibliotek

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

Download snpomatic

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
i386	78.8 kB	196.0 kB	[list of files]