Package: macs (2.1.2.1-1)

[ Source: macs  ]

Modelbaseret analyse af ChIP-Seq på korte læsesekvenser

MACS opbygger empirisk længden af de sekventerede ChIP-fragmenter, som tenderer til at være kortere end lydbehandling eller størrelsesestimater for bibliotekskonstruktion og bruger den til at forbedre den rumlige opløsning af forudsagte bindingssteder. MACS bruger også en dynamisk Poisson-fordeling til effektivt at fange lokale skævheder i arvemassesekvensen, hvilket giver mulighed for mere følsom og robust forudsigelse. MACS sammenligner positivt til eksisterende ChIP-Seq peak-finding-algoritmer, er offentligt tilgængelig åben kildekode og kan bruges til ChIP-Seq med eller uden kontrolprøver.

Other Packages Related to macs

• dep: cython

  C-udvidelser til Python

• dep: libc6 (>= 2.4)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: python

  Interaktivt objektorienteret sprog på højt niveau - Python 2-version

  dep: python (<< 2.8)

  dep: python (>= 2.7~)

• dep: python-numpy

  Numerisk Python tilføjer en hurtig vektor-/array-facilitet til Pythonsproget

Download macs

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
i386	2,231.7 kB	5,714.0 kB	[list of files]