Package: edlib-aligner (1.2.4-1)

[ Source: libedlib  ]

Edlib-sekvenssammenligningsværktøj der bruger edit distance

Edlib er et simpelt og super hurtigt C/C++-bibliotek til sekvenssammenligning via edit distance. Denne pakke tilbyder en sammenligner, der bruger dette bibliotek.

Funktioner i libedlib:

 * Beregner edit distance (Levehnstein distance)
 * Kan finde optimale sammenligningssti (instruktioner om transformering
   af den første sekvens til den anden sekvens)
 * Understøtter flere sammenligningsmetoder: global(NW), prefix(SHW) og
   infix(HW), hver af dem nyttige i forskellige scenarier
 * Du kan udvide tegnlighedsdefinitionen, så du f.eks. kan have jokertegn,
   for sammenligning uden hensyn til store/små bogstaver eller til at
   arbejde med degenererede nukleotider
 * Kan nemt håndtere små eller meget store sekvenser, selv når
   sammenligningsstier skal findes, men med meget lille hukommelsesforbrug
 * Super hurtig takket være Myers' bit-vektor algoritme

Other Packages Related to edlib-aligner

• dep: libc6 (>= 2.4)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libedlib0 (= 1.2.4-1)

  Bibliotek for sekvenssammenligning via edit distance

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

  GCC støttebibliotek

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

Download edlib-aligner

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
i386	22.9 kB	68.0 kB	[list of files]