Package: freebayes (1.2.0-2)

[ Source: freebayes  ]

Bayesian haplotype-baseret polymorfiregistrering og genotypebestemmelse

FreeBayes er en Bayesian genetisk variantdetektor designet til at finde små polymorfier, specifikt SNP'er (enkel-nukleotid polymorfier), indel'er (indsættelser og sletninger), MNP'er (fler-nukleotide polymorfier)og komplekse hændelser (sammensat indsættelse og erstatningshændelser) mindre end længden af en kort-læst sekvenssammenligning.

Other Packages Related to freebayes

• dep: libbamtools2.5.1

  Dynamisk bibliotek til at manipulere BAM-filer (genomsammenligning)

• dep: libc6 (>= 2.14)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libdisorder0 (>= 0.0.2)

  Bibliotek for entropimåling af bytestrømme

• dep: libfastahack0 (>= 0.0+git20160702.bbc645f)

  Bibliotek for indeksering og sekvensudtrækning fra FASTA-filer - bibliotek

• dep: libfml0

  Bibliotek til at samle Illumina-korte læsninger i små regioner

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

  GCC støttebibliotek

• dep: libhts2 (>= 1.0)

  C-bibliotek for høj-gennemløb sekvensdataformater

• dep: libjsoncpp1 (>= 1.7.4)

  library for reading and writing JSON for C++

• dep: libseqlib1 (>= 1.1.2+dfsg)

  C++ htslib/bwa-mem/fermi-grænseflade for interrogating sequence-data

• dep: libsmithwaterman0 (>= 0.0+git20160702.2610e25)

  Bestem lignende regioner mellem to strenge eller genomsekvenser - bibliotek

• dep: libssw0

  fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: libtabixpp0

  C++ wrapper to tabix indexer

• dep: libvcflib1

  C++-bibliotek til at fortolke og manipulere VCF-filer

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

• rec: parallel

  Byg og afvikl kommandolinjer fra standardind parallelt

Download freebayes

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	997.6 kB	3,441.0 kB	[list of files]