Package: python-biom-format (2.1.7+dfsg-2)

[ Source: python-biom-format  ]

Biological Observation Matrix-format (BIOM) - Python 2

BIOM-filformatet (kanonisk udtalt biome) er designet til at være et alment format for repræsentation af biologisk prøve efter observationsuforudsete tabeller. BIOM er en anerkendt standard for Earth Microbiome Project og er et Genomics Standards Consortium-kandidatprojekt.

BIOM-formatet er designet for almen brug i brede områder for komparative -omics. For eksempel i undersøgelser for marker-gene, den primære brug for dette format er at repræsentere OTU-tabeller: Observationerne i dette tilfælde er OTU'er og matrixen indeholder antal svarende til antallet af gange hver OTU observeres i hver prøve. Med hensyn til metagenom-data, vil dette format blive brugt til at repræsentere metagenome-tabeller: Observationerne i dette tilfælde kan svare til SEED-undersystemer, og matrixen vil indeholder antal svarende til antallet af gange hvert undersystem observeres i hvert metagenom. På samme måde med hensyn til genom-data kan dette format bruges til at repræsentere et sæt af genomer: observationerne i dette tilfælde kan igen tilsvare SEED-undersystemer, og antallet vil tilsvare antallet af gange hvert undersystem er observeret i hvert genom.

Denne pakke tilbyder BIOM-formatbiblioteket for Python 2-fortolkeren.

Other Packages Related to python-biom-format

• dep: libc6 (>= 2.4)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: pyqi

  Pythonramme for omslag omkring generelle kommandoer i flere grænseflader

• dep: python

  Interaktivt objektorienteret sprog på højt niveau - Python 2-version

  dep: python (<< 2.8)

  dep: python (>= 2.7~)

• dep: python-click

  Wrapper around optparse for command line utilities - Python 2.7

• dep: python-future

  Single-source-understøttelse for Python 3 og 2 - Python 2.x

• dep: python-numpy (>= 1:1.16.0~rc1)

  Numerisk Python tilføjer en hurtig vektor-/array-facilitet til Pythonsproget

• dep: python-numpy-abi9

  virtual package provided by python-numpy

• dep: python-pandas

  Datastrukturer for »relationelle« data eller »etiketdata«

• dep: python-scipy

  Videnskabelige værktøjer for Python

• dep: python-six (>= 1.10.0)

  Python 2- og 3-kompatibilitetsbibliotek - Python 2-grænseflade

• sug: python-biom-format-doc

  Dokumentation for BIOM-formatet

Download python-biom-format

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
armhf	134.0 kB	602.0 kB	[list of files]