Package: libfastahack-dev (0.0+git20160702.bbc645f+dfsg-6)

[ Source: libfastahack  ]

Bibliotek for indeksering og sekvensudtrækning fra FASTA-filer - udvikling

Fastahack er et lille program til indeksering og udtrækning af sekvenser og undersekvenser fra FASTA-filer. Det inkluderede Fasta.cpp-bibliotek tilbyder en FASTA-læser og et indeksprogram, som kan indlejres i programmer, som vil have nytte af direkte læsning af undersekvenser fra FASTA-filer. Biblioteket håndterer automatisk oprettelse af indeksfil og brug.

Funktioner:

 * FASTA-indeksoprettelse (.fai) for FASTA-filer
 * Sekvensudtrækning
 * Undersekvensudtrækning
 * Sekvensstatistik (i øjeblikket er kun entropi indeholdt)

Sekvens- og undersekvensudtrækning bruger fseek64 til at tilbyde hurtigst mulig udtrækning uden RAM-intensive operationer for filindlæsning. Dette gør fastahack til et nyttigt værktøj for bioinformatikere, som hurtigt skal udtrække mange undersekvenser fra en FASTA-referencesekvens.

Dette er udviklingspakken indeholdende det statisk lænkede bibliotek og teksthovedfilerne.

Tags: Software Development: Libraries, Role: Development Library

Other Packages Related to libfastahack-dev

• dep: libfastahack0 (= 0.0+git20160702.bbc645f+dfsg-6)

  Bibliotek for indeksering og sekvensudtrækning fra FASTA-filer - bibliotek

Download libfastahack-dev

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
armhf	22.9 kB	91.0 kB	[list of files]