Package: libjellyfish-2.0-2 (2.2.10-2)
Links for libjellyfish-2.0-2
Debian Resources:
Download Source Package jellyfish:
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Shaun Jackman (QA Page)
- Andreas Tille (QA Page)
- Michael R. Crusoe (QA Page)
External Resources:
- Homepage [www.cbcb.umd.edu]
Similar packages:
Tæl k-mers i DNA-sekvenser - dynamisk bibliotek for jellyfish
JELLYFISH er et værktøj for hurtig, hukommelseseffektiv optælling af k-mers i DNA. En k-mer er en understreng med længden k, og optælling af forekomsterne af alle sådanne understrenge er et centralt trin i mange analyser af DNA-sekvenser. JELLYFISH kan optælle k-mers via en i størrelsesorden mindre brug af hukommelse og via en i størrelsesorden større hurtighed end andre k-mer optællingspakker ved at bruge en effektiv kodning af en hashtabel og ved at udnytte cpu-instruktionen »compare-and- swap« til at øge parallelisme.
JELLYFISH er et program for kommandolinjen, som læser FASTA- og multi- FASTA-filer indeholdende DNA-sekvenser. Den fremstiller sin k-mer- optælling i et binært format, som kan oversættes til et læsevenligt tekstformat via kommandoen »jellyfish dump«.
Denne pakke indeholder det dynamiske bibliotek som den kørbare fil for jellyfish er lænket til.
Other Packages Related to libjellyfish-2.0-2
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.17)
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libgcc1 (>= 1:3.0)
- GCC støttebibliotek
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU Standard C++ bibliotek v3
Download libjellyfish-2.0-2
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| arm64 | 58.7 kB | 188.0 kB | [list of files] |